Delete wyniki/redukcja wymiarowosci/eksperyment 2/wyniki_svm_TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean_20250826_105344.txt
This commit is contained in:
parent
98186f6a03
commit
1f79cb86bb
|
|
@ -1,505 +0,0 @@
|
|||
======= ROZPOCZĘCIE EKSPERYMENTU DLA PLIKU: dane/TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean.csv =======
|
||||
Wyniki będą zapisane w: wyniki/dim_reduction/23082025-clean/wyniki_svm_TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean_20250826_105344.txt
|
||||
======= INFORMACJE O ŚRODOWISKU =======
|
||||
Data i czas rozpoczęcia: 2025-08-26 10:53:44
|
||||
Wersja NumPy: 1.24.3
|
||||
Wersja Pandas: 2.0.3
|
||||
Wersja scikit-learn: 1.3.0
|
||||
Wersja Qiskit: 0.25.1
|
||||
Wersja qiskit-machine-learning: 0.6.0
|
||||
Wersja dimod: 0.12.20
|
||||
Wersja neal: 0.6.0
|
||||
|
||||
======= WYBRANE EKSPERYMENTY =======
|
||||
Klasyczny SVM: TAK
|
||||
Kwantowy SVM: TAK
|
||||
Podejście hybrydowe: TAK
|
||||
|
||||
======= AKTYWOWANE MAPY CECH =======
|
||||
ZZ1: NIE
|
||||
ZZ2: NIE
|
||||
Pauli1: NIE
|
||||
Pauli2: NIE
|
||||
Z1: NIE
|
||||
Z2: NIE
|
||||
ZZ1_new: NIE
|
||||
ZZ2_new: NIE
|
||||
Amplitude_l2: TAK
|
||||
Amplitude_l1: TAK
|
||||
Amplitude_min-max: TAK
|
||||
|
||||
======= PRZYGOTOWANIE DANYCH =======
|
||||
Wymiary oryginalnych danych: (858, 27)
|
||||
Unikalne wartości zmiennej docelowej: ['Oligodendroglioma, NOS' 'Mixed glioma' 'Astrocytoma, NOS'
|
||||
'Astrocytoma, anaplastic' 'Oligodendroglioma, anaplastic' 'Glioblastoma']
|
||||
Rozkład klas: {'Glioblastoma': 360, 'Astrocytoma, anaplastic': 129, 'Mixed glioma': 128, 'Oligodendroglioma, NOS': 108, 'Oligodendroglioma, anaplastic': 75, 'Astrocytoma, NOS': 58}
|
||||
Wymiary danych po usunięciu kolumn identyfikacyjnych: (858, 24)
|
||||
Przekształcanie kolumn kategorycznych na binarne...
|
||||
Kolumny kategoryczne do przekształcenia: ['Gender', 'Primary_Diagnosis', 'Race', 'IDH1', 'TP53', 'ATRX', 'PTEN', 'EGFR', 'CIC', 'MUC16', 'PIK3CA', 'NF1', 'PIK3R1', 'FUBP1', 'RB1', 'NOTCH1', 'BCOR', 'CSMD3', 'SMARCA4', 'GRIN2A', 'IDH2', 'FAT4', 'PDGFRA']
|
||||
Kolumna Gender zawiera wartości: ['Male' 'Female']
|
||||
Kolumna Primary_Diagnosis zawiera wartości: ['Oligodendroglioma, NOS' 'Mixed glioma' 'Astrocytoma, NOS'
|
||||
'Astrocytoma, anaplastic' 'Oligodendroglioma, anaplastic' 'Glioblastoma']
|
||||
Kolumna Primary_Diagnosis zostanie zakodowana jako one-hot.
|
||||
Kolumna Race zawiera wartości: ['white' 'asian' 'black or african american' 'not reported'
|
||||
'american indian or alaska native']
|
||||
Kolumna Race zostanie zakodowana jako one-hot.
|
||||
Kolumna IDH1 zawiera wartości: ['MUTATED' 'NOT_MUTATED']
|
||||
Kolumna TP53 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna ATRX zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna PTEN zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna EGFR zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna CIC zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna MUC16 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna PIK3CA zawiera wartości: ['MUTATED' 'NOT_MUTATED']
|
||||
Kolumna NF1 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna PIK3R1 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna FUBP1 zawiera wartości: ['MUTATED' 'NOT_MUTATED']
|
||||
Kolumna RB1 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna NOTCH1 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna BCOR zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna CSMD3 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna SMARCA4 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna GRIN2A zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna IDH2 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna FAT4 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Kolumna PDGFRA zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||
Wymiary danych po przekształceniu: (858, 31)
|
||||
Wypełnianie brakujących wartości...
|
||||
Wymiary danych wejściowych: (858, 31)
|
||||
Wymiary danych po skalowaniu: (858, 31)
|
||||
|
||||
======= REDUKCJA WYMIAROWOŚCI =======
|
||||
|
||||
Testowanie PCA z 8 komponentami...
|
||||
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 8)
|
||||
Wyjaśniona wariancja: 0.4687
|
||||
Czas wykonania PCA: 0.01 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie PCA z 10 komponentami...
|
||||
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 10)
|
||||
Wyjaśniona wariancja: 0.5410
|
||||
Czas wykonania PCA: 0.01 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie PCA z 12 komponentami...
|
||||
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 12)
|
||||
Wyjaśniona wariancja: 0.6090
|
||||
Czas wykonania PCA: 0.02 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie PCA z 14 komponentami...
|
||||
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 14)
|
||||
Wyjaśniona wariancja: 0.6728
|
||||
Czas wykonania PCA: 0.02 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie PCA z 16 komponentami...
|
||||
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 16)
|
||||
Wyjaśniona wariancja: 0.7342
|
||||
Czas wykonania PCA: 0.03 sekund
|
||||
|
||||
Wyniki redukcji wymiarowości zapisane do: wyniki/dim_reduction/23082025-clean/dimension_reduction_results_TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean.json
|
||||
|
||||
Wybrano najlepszą wersję redukcji wymiarowości: pca_8
|
||||
Wymiary domyślnego zbioru treningowego: (600, 8)
|
||||
Wymiary domyślnego zbioru testowego: (258, 8)
|
||||
|
||||
Dostępne wersje zredukowanych danych:
|
||||
pca_8: Train (600, 8), Test (258, 8)
|
||||
pca_10: Train (600, 10), Test (258, 10)
|
||||
pca_12: Train (600, 12), Test (258, 12)
|
||||
pca_14: Train (600, 14), Test (258, 14)
|
||||
pca_16: Train (600, 16), Test (258, 16)
|
||||
|
||||
Czas przygotowania danych: 0.16 sekund
|
||||
|
||||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
|
||||
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: default
|
||||
Wymiary danych: X_train (600, 8), X_test (258, 8)
|
||||
Rozpoczęcie GridSearchCV dla default...
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM (default): {'C': 100, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM (default): 0.9500
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - default):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.88 0.79 0.83 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.89 0.95 0.92 42
|
||||
Glioblastoma 0.98 0.94 0.96 109
|
||||
Mixed glioma 0.90 0.97 0.94 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 0.97 0.97 0.97 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 0.94 0.94 0.94 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.94 258
|
||||
macro avg 0.93 0.93 0.93 258
|
||||
weighted avg 0.94 0.94 0.94 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (default):
|
||||
Accuracy: 0.9419
|
||||
Precision: 0.9431
|
||||
Recall: 0.9419
|
||||
F1 Score: 0.9418
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 15 2 0 1 1 0]
|
||||
[ 0 40 2 0 0 0]
|
||||
[ 1 3 103 2 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 37 0 1]
|
||||
[ 0 0 0 1 32 0]
|
||||
[ 1 0 0 0 0 16]]
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (default): 1.30 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_8
|
||||
Wymiary danych: X_train (600, 8), X_test (258, 8)
|
||||
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_8...
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_8): {'C': 100, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM (pca_8): 0.9500
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_8):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.88 0.79 0.83 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.89 0.95 0.92 42
|
||||
Glioblastoma 0.98 0.94 0.96 109
|
||||
Mixed glioma 0.90 0.97 0.94 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 0.97 0.97 0.97 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 0.94 0.94 0.94 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.94 258
|
||||
macro avg 0.93 0.93 0.93 258
|
||||
weighted avg 0.94 0.94 0.94 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_8):
|
||||
Accuracy: 0.9419
|
||||
Precision: 0.9431
|
||||
Recall: 0.9419
|
||||
F1 Score: 0.9418
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 15 2 0 1 1 0]
|
||||
[ 0 40 2 0 0 0]
|
||||
[ 1 3 103 2 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 37 0 1]
|
||||
[ 0 0 0 1 32 0]
|
||||
[ 1 0 0 0 0 16]]
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_8): 1.29 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_10
|
||||
Wymiary danych: X_train (600, 10), X_test (258, 10)
|
||||
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_10...
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_10): {'C': 10, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM (pca_10): 0.9750
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_10):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.94 0.89 0.92 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.93 0.98 0.95 42
|
||||
Glioblastoma 0.98 0.97 0.98 109
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.98 258
|
||||
macro avg 0.98 0.97 0.97 258
|
||||
weighted avg 0.98 0.98 0.98 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_10):
|
||||
Accuracy: 0.9767
|
||||
Precision: 0.9770
|
||||
Recall: 0.9767
|
||||
F1 Score: 0.9767
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 17 1 1 0 0 0]
|
||||
[ 0 41 1 0 0 0]
|
||||
[ 1 2 106 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 38 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_10): 1.24 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_12
|
||||
Wymiary danych: X_train (600, 12), X_test (258, 12)
|
||||
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_12...
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_12): {'C': 10, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM (pca_12): 0.9817
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_12):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.95 0.95 0.95 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.95 1.00 0.98 42
|
||||
Glioblastoma 0.98 0.97 0.98 109
|
||||
Mixed glioma 1.00 0.97 0.99 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.98 258
|
||||
macro avg 0.98 0.98 0.98 258
|
||||
weighted avg 0.98 0.98 0.98 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_12):
|
||||
Accuracy: 0.9806
|
||||
Precision: 0.9809
|
||||
Recall: 0.9806
|
||||
F1 Score: 0.9806
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 18 0 1 0 0 0]
|
||||
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||
[ 1 2 106 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 1 37 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_12): 1.27 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_14
|
||||
Wymiary danych: X_train (600, 14), X_test (258, 14)
|
||||
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_14...
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_14): {'C': 0.1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM (pca_14): 0.9833
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_14):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.90 0.95 0.92 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 42
|
||||
Glioblastoma 0.99 0.99 0.99 109
|
||||
Mixed glioma 1.00 0.97 0.99 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.99 258
|
||||
macro avg 0.98 0.99 0.98 258
|
||||
weighted avg 0.99 0.99 0.99 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_14):
|
||||
Accuracy: 0.9884
|
||||
Precision: 0.9888
|
||||
Recall: 0.9884
|
||||
F1 Score: 0.9885
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 18 0 1 0 0 0]
|
||||
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||
[ 1 0 108 0 0 0]
|
||||
[ 1 0 0 37 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_14): 1.38 sekund
|
||||
|
||||
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_16
|
||||
Wymiary danych: X_train (600, 16), X_test (258, 16)
|
||||
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_16...
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_16): {'C': 100, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM (pca_16): 0.9917
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_16):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.86 0.95 0.90 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.95 1.00 0.98 42
|
||||
Glioblastoma 0.99 0.95 0.97 109
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.98 258
|
||||
macro avg 0.97 0.98 0.97 258
|
||||
weighted avg 0.98 0.98 0.98 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_16):
|
||||
Accuracy: 0.9767
|
||||
Precision: 0.9781
|
||||
Recall: 0.9767
|
||||
F1 Score: 0.9770
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 18 0 1 0 0 0]
|
||||
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||
[ 3 2 104 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 38 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_16): 1.50 sekund
|
||||
|
||||
Wyniki klasycznego SVM zapisane do: wyniki/dim_reduction/23082025-clean/classic_svm_results_TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean.json
|
||||
|
||||
======= SVM Z JĄDREM KWANTOWYM =======
|
||||
Brak wyników w cache, używanie tymczasowych wyników.
|
||||
|
||||
DEBUG - Wymiary danych treningowych: (600, 8)
|
||||
Testowanie Amplitude_l2 z C=0.1...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l2...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=0.1: 0.7417 (czas: 4.14 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l2 z C=1.0...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l2...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=1.0: 0.8517 (czas: 4.10 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l2 z C=10.0...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l2...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=10.0: 0.8700 (czas: 4.09 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l1 z C=0.1...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l1...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=0.1: 0.4183 (czas: 4.09 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l1 z C=1.0...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l1...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=1.0: 0.4500 (czas: 4.08 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l1 z C=10.0...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l1...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=10.0: 0.8350 (czas: 4.09 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_min-max z C=0.1...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją min-max...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=0.1: 0.7900 (czas: 4.17 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_min-max z C=1.0...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją min-max...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=1.0: 0.8817 (czas: 4.25 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_min-max z C=10.0...
|
||||
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją min-max...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9300 (czas: 4.20 s)
|
||||
Najlepszy kwantowy SVM: Amplitude_min-max z C=10.0, dokładność: 0.9300
|
||||
Ewaluacja najlepszego modelu z kodowaniem amplitudowym (normalizacja: min-max)...
|
||||
Raport klasyfikacji (najlepszy kwantowy SVM z kodowaniem amplitudowym, normalizacja: min-max):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.89 0.89 0.89 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.86 0.90 0.88 42
|
||||
Glioblastoma 0.95 0.96 0.96 109
|
||||
Mixed glioma 0.95 0.95 0.95 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.97 0.98 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 0.93 0.82 0.87 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.94 258
|
||||
macro avg 0.93 0.92 0.92 258
|
||||
weighted avg 0.94 0.94 0.94 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Kwantowy SVM z kodowaniem amplitudowym (min-max):
|
||||
Accuracy: 0.9380
|
||||
Precision: 0.9387
|
||||
Recall: 0.9380
|
||||
F1 Score: 0.9380
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 17 2 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 38 4 0 0 0]
|
||||
[ 1 3 105 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 1 36 0 1]
|
||||
[ 1 0 0 0 32 0]
|
||||
[ 0 1 0 2 0 14]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla kwantowego SVM: 40.34 sekund
|
||||
|
||||
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||
Używanie mniejszego zbioru danych dla ewaluacji: (240, 8)
|
||||
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||
Używanie 3 map cech w podejściu hybrydowym: ['Amplitude_l2', 'Amplitude_l1', 'Amplitude_min-max']
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l2, C=0.1: 0.7417
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l2, C=1.0: 0.8517
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l2, C=10.0: 0.8700
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l1, C=0.1: 0.4183
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l1, C=1.0: 0.4500
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l1, C=10.0: 0.8350
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_min-max, C=0.1: 0.7900
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_min-max, C=1.0: 0.8817
|
||||
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9300
|
||||
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania kwantowego...
|
||||
Czas wyżarzania kwantowego: 0.03 sekund
|
||||
Optymalne hiperparametry z wyżarzania kwantowego: feature_map=Amplitude_min-max, C=10.0
|
||||
Trenowanie modelu hybrydowego z kodowaniem amplitudowym (normalizacja: min-max)...
|
||||
Czas trenowania modelu hybrydowego: 2.07 sekund
|
||||
Czas ewaluacji modelu hybrydowego: 0.90 sekund
|
||||
Dokładność ostatecznego modelu hybrydowego: 0.9380
|
||||
Raport klasyfikacji (model hybrydowy):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.89 0.89 0.89 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.86 0.90 0.88 42
|
||||
Glioblastoma 0.95 0.96 0.96 109
|
||||
Mixed glioma 0.95 0.95 0.95 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.97 0.98 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 0.93 0.82 0.87 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.94 258
|
||||
macro avg 0.93 0.92 0.92 258
|
||||
weighted avg 0.94 0.94 0.94 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Model hybrydowy:
|
||||
Accuracy: 0.9380
|
||||
Precision: 0.9387
|
||||
Recall: 0.9380
|
||||
F1 Score: 0.9380
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 17 2 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 38 4 0 0 0]
|
||||
[ 1 3 105 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 1 36 0 1]
|
||||
[ 1 0 0 0 32 0]
|
||||
[ 0 1 0 2 0 14]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 3.03 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 0.9767441860465116
|
||||
Kwantowy SVM (bez wyżarzania): 0.9300
|
||||
Model hybrydowy: 0.9380
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE CZASÓW WYKONANIA =======
|
||||
Czas przygotowania danych: 0.16 sekund
|
||||
Czas klasycznego SVM: 1.50 sekund
|
||||
Czas kwantowego SVM: 40.34 sekund
|
||||
Czas podejścia hybrydowego: 3.03 sekund
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Wytrenowanie modelu na oryginalnych danych do analizy znaczenia cech...
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.2725
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.2221
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.2202
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.2198
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.1264
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 3.04 sekund
|
||||
|
||||
======= KLUCZOWE MUTACJE ZWIĄZANE Z KLASYFIKACJĄ NOWOTWORÓW =======
|
||||
Kluczowe mutacje:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.2725
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.2221
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.2202
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.2198
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.1264
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-26 10:54:39
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 54.65 sekund (0.91 minut)
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE METRYK =======
|
||||
Klasyczny SVM:
|
||||
accuracy: 0.9767441860465116
|
||||
precision: 0.9780563106144502
|
||||
recall: 0.9767441860465116
|
||||
f1: 0.9770045777038696
|
||||
roc_auc: N/A
|
||||
|
||||
Kwantowy SVM:
|
||||
accuracy: 0.937984496124031
|
||||
precision: 0.9387009631195677
|
||||
recall: 0.937984496124031
|
||||
f1: 0.9380005221212427
|
||||
roc_auc: N/A
|
||||
|
||||
Model hybrydowy:
|
||||
accuracy: 0.937984496124031
|
||||
precision: 0.9387009631195677
|
||||
recall: 0.937984496124031
|
||||
f1: 0.9380005221212427
|
||||
roc_auc: N/A
|
||||
Loading…
Reference in New Issue