Upload files to "wyniki/eksperyment_glowny/1"
This commit is contained in:
parent
f05ef157bc
commit
6012e79c34
|
|
@ -0,0 +1,106 @@
|
|||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 0.1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 42
|
||||
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 109
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||
|
||||
accuracy 1.00 258
|
||||
macro avg 1.00 1.00 1.00 258
|
||||
weighted avg 1.00 1.00 1.00 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
|
||||
Accuracy: 1.0000
|
||||
Precision: 1.0000
|
||||
Recall: 1.0000
|
||||
F1 Score: 1.0000
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 19 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 109 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 38 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 17.72 sekund
|
||||
|
||||
======= KWANTOWY SVM Z AMPLITUDE ENCODING =======
|
||||
Testowanie Amplitude_l2 z C=0.1...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=0.1: 0.7650 (czas: 3.04 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l2 z C=1.0...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=1.0: 0.9117 (czas: 3.06 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l2 z C=10.0...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=10.0: 0.9333 (czas: 3.00 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l1 z C=0.1...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=0.1: 0.4183 (czas: 2.96 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l1 z C=1.0...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=1.0: 0.4183 (czas: 2.98 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_l1 z C=10.0...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=10.0: 0.8000 (czas: 2.94 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_min-max z C=0.1...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=0.1: 0.9583 (czas: 2.92 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_min-max z C=1.0...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=1.0: 0.9767 (czas: 2.96 s)
|
||||
Testowanie Amplitude_min-max z C=10.0...
|
||||
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9767 (czas: 2.89 s)
|
||||
|
||||
Najlepszy kwantowy SVM: Amplitude_min-max z C=1.0, dokładność: 0.9767
|
||||
Ewaluacja najlepszego modelu z kodowaniem amplitudowym (normalizacja: min-max)...
|
||||
Raport klasyfikacji (najlepszy kwantowy SVM z kodowaniem amplitudowym, normalizacja: min-max):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.90 0.95 0.92 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.89 1.00 0.94 42
|
||||
Glioblastoma 1.00 0.95 0.98 109
|
||||
Mixed glioma 1.00 0.97 0.99 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.97 258
|
||||
macro avg 0.97 0.98 0.97 258
|
||||
weighted avg 0.98 0.97 0.97 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Kwantowy SVM z kodowaniem amplitudowym (min-max):
|
||||
Accuracy: 0.9729
|
||||
Precision: 0.9753
|
||||
Recall: 0.9729
|
||||
F1 Score: 0.9733
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 18 1 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||
[ 1 4 104 0 0 0]
|
||||
[ 1 0 0 37 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla kwantowego SVM: 27.27 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 1.0000
|
||||
Kwantowy SVM: 0.9729
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3267
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1795
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1628
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1419
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0709
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 264.58 sekund
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU AMPLITUDE =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-06 23:20:49
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 1754515249.57 sekund
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,145 @@
|
|||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM: 0.9991701244813278
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 1.00 1.00 1.00 2
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 26
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 83
|
||||
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 222
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 67
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 74
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 44
|
||||
|
||||
accuracy 1.00 518
|
||||
macro avg 1.00 1.00 1.00 518
|
||||
weighted avg 1.00 1.00 1.00 518
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
|
||||
Accuracy: 1.0000
|
||||
Precision: 1.0000
|
||||
Recall: 1.0000
|
||||
F1 Score: 1.0000
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 2 0 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 26 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 83 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 222 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 67 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 74 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 0 44]]
|
||||
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 62.43 sekund
|
||||
|
||||
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||
Wczytano 2 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_zz_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_1percent_added.json
|
||||
Wczytano 1 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_pauli_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_1percent_added.json
|
||||
Wczytano 6 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_z_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_1percent_added.json
|
||||
Wczytano 9 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_amplitude_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_1percent_added.json
|
||||
Łącznie wczytano 18 wyników kwantowych
|
||||
|
||||
Wszystkie wyniki kwantowe:
|
||||
Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9875
|
||||
Amplitude_min-max, C=1.0: 0.9867
|
||||
Amplitude_min-max, C=0.1: 0.9851
|
||||
Amplitude_l2, C=10.0: 0.9817
|
||||
Amplitude_l2, C=1.0: 0.9676
|
||||
Amplitude_l1, C=10.0: 0.8863
|
||||
Amplitude_l2, C=0.1: 0.8739
|
||||
Z1, C=10.0: 0.8209
|
||||
Z2, C=10.0: 0.8209
|
||||
Z1, C=1.0: 0.8159
|
||||
Z2, C=1.0: 0.8117
|
||||
ZZ1, C=1.0: 0.7231
|
||||
Z2, C=0.1: 0.5390
|
||||
Z1, C=0.1: 0.5381
|
||||
Amplitude_l1, C=1.0: 0.4304
|
||||
ZZ1, C=0.1: 0.4130
|
||||
Pauli1, C=0.1: 0.4130
|
||||
Amplitude_l1, C=0.1: 0.4130
|
||||
|
||||
Najlepszy wynik: Amplitude_min-max z C=10.0, score=0.9875
|
||||
|
||||
======= WYŻARZANIE SYMULOWANE =======
|
||||
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=0.1: 0.4130
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=1.0: 0.7231
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=0.1: 0.4130
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=0.1: 0.5381
|
||||
Wynik dla Z1, C=1.0: 0.8159
|
||||
Wynik dla Z1, C=10.0: 0.8209
|
||||
Wynik dla Z2, C=0.1: 0.5390
|
||||
Wynik dla Z2, C=1.0: 0.8117
|
||||
Wynik dla Z2, C=10.0: 0.8209
|
||||
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania symulowanego...
|
||||
Czas wyżarzania symulowanego: 9.83 sekund
|
||||
Optymalne hiperparametry z wyżarzania symulowanego: feature_map=Z2, C=10.0
|
||||
Czas trenowania modelu hybrydowego: 6183.50 sekund
|
||||
Czas ewaluacji modelu hybrydowego: 4938.32 sekund
|
||||
Dokładność ostatecznego modelu hybrydowego: 0.8707
|
||||
Raport klasyfikacji (model hybrydowy):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 1.00 0.50 0.67 2
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 0.88 0.94 26
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 0.78 0.88 83
|
||||
Glioblastoma 0.77 1.00 0.87 222
|
||||
Mixed glioma 0.98 0.82 0.89 67
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.65 0.79 74
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 0.84 0.91 44
|
||||
|
||||
accuracy 0.87 518
|
||||
macro avg 0.96 0.78 0.85 518
|
||||
weighted avg 0.90 0.87 0.87 518
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Model hybrydowy:
|
||||
Accuracy: 0.8707
|
||||
Precision: 0.8995
|
||||
Recall: 0.8707
|
||||
F1 Score: 0.8692
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 1 0 0 1 0 0 0]
|
||||
[ 0 23 0 3 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 65 18 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 222 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 12 55 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 25 1 48 0]
|
||||
[ 0 0 0 7 0 0 37]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 11131.70 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 1.0000
|
||||
Model hybrydowy: 0.8707
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.2664
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1461
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1305
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1195
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0846
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0486
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 702.38 sekund
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU HYBRYDOWEGO =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-14 12:10:49
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 1755166249.57 sekund
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,133 @@
|
|||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM: 0.9983333333333334
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 1.00 1.00 1.00 2
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 45
|
||||
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 107
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 35
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 31
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 20
|
||||
|
||||
accuracy 1.00 259
|
||||
macro avg 1.00 1.00 1.00 259
|
||||
weighted avg 1.00 1.00 1.00 259
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
|
||||
Accuracy: 1.0000
|
||||
Precision: 1.0000
|
||||
Recall: 1.0000
|
||||
F1 Score: 1.0000
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 2 0 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 19 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 45 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 107 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 35 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 31 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 0 20]]
|
||||
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 18.55 sekund
|
||||
|
||||
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||
Wczytano 9 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_amplitude_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_1percent_substituted.json
|
||||
Łącznie wczytano 9 wyników kwantowych
|
||||
|
||||
Wszystkie wyniki kwantowe:
|
||||
Amplitude_min-max, C=1.0: 0.9834
|
||||
Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9834
|
||||
Amplitude_min-max, C=0.1: 0.9817
|
||||
Amplitude_l2, C=10.0: 0.9635
|
||||
Amplitude_l2, C=1.0: 0.9436
|
||||
Amplitude_l2, C=0.1: 0.8012
|
||||
Amplitude_l1, C=10.0: 0.7978
|
||||
Amplitude_l1, C=0.1: 0.4183
|
||||
Amplitude_l1, C=1.0: 0.4183
|
||||
|
||||
Najlepszy wynik: Amplitude_min-max z C=1.0, score=0.9834
|
||||
|
||||
======= WYŻARZANIE SYMULOWANE =======
|
||||
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania symulowanego...
|
||||
Czas wyżarzania symulowanego: 10.37 sekund
|
||||
Optymalne hiperparametry z wyżarzania symulowanego: feature_map=Z2, C=10.0
|
||||
Czas trenowania modelu hybrydowego: 1487.30 sekund
|
||||
Czas ewaluacji modelu hybrydowego: 1311.91 sekund
|
||||
Dokładność ostatecznego modelu hybrydowego: 0.6834
|
||||
Raport klasyfikacji (model hybrydowy):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 0.00 0.00 0.00 2
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 0.53 0.69 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 0.40 0.57 45
|
||||
Glioblastoma 0.57 1.00 0.72 107
|
||||
Mixed glioma 1.00 0.57 0.73 35
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.55 0.71 31
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 0.25 0.40 20
|
||||
|
||||
accuracy 0.68 259
|
||||
macro avg 0.80 0.47 0.55 259
|
||||
weighted avg 0.81 0.68 0.66 259
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Model hybrydowy:
|
||||
Accuracy: 0.6834
|
||||
Precision: 0.8130
|
||||
Recall: 0.6834
|
||||
F1 Score: 0.6625
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 0 0 0 2 0 0 0]
|
||||
[ 0 10 0 9 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 18 27 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 107 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 15 20 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 14 0 17 0]
|
||||
[ 0 0 0 15 0 0 5]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 2809.60 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 1.0000
|
||||
Model hybrydowy: 0.6834
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3347
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1772
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1556
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1116
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0811
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0784
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 283.94 sekund
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU HYBRYDOWEGO =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-15 12:18:08
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 1755253088.31 sekund
|
||||
Loading…
Reference in New Issue