administrator
/
Genomic_data_QSVM
1
0
Fork 0
Code Issues Pull Requests Packages Projects Releases Wiki Activity

Upload files to "wyniki/eksperyment_glowny/1"

This commit is contained in:
Michał Kasprowicz 2025-08-30 11:57:35 +00:00
parent cd3d54c4b3
commit d1ce280f57
5 changed files with 474 additions and 0 deletions
Show Stats Download Patch File Download Diff File Expand all files Collapse all files

105
wyniki/eksperyment_glowny/1/z_10percent_added.txt Normal file
View File

@ -0,0 +1,105 @@
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
precision recall f1-score support
-- 1.00 1.00 1.00 8
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 27
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 82
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 219
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 65
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 71
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 46
accuracy 1.00 518
macro avg 1.00 1.00 1.00 518
weighted avg 1.00 1.00 1.00 518
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
Accuracy: 1.0000
Precision: 1.0000
Recall: 1.0000
F1 Score: 1.0000
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 8 0 0 0 0 0 0]
[ 0 27 0 0 0 0 0]
[ 0 0 82 0 0 0 0]
[ 0 0 0 219 0 0 0]
[ 0 0 0 0 65 0 0]
[ 0 0 0 0 0 71 0]
[ 0 0 0 0 0 0 46]]
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 59.41 sekund
======= KWANTOWY SVM Z Z FEATURE MAPS =======
Testowanie 2 map cech: ['Z1', 'Z2']
Testowanie Z1 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=0.1: 0.3980 (czas: 39108.95 s)
Testowanie Z1 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=1.0: 0.5290 (czas: 36583.47 s)
Testowanie Z1 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=10.0: 0.5530 (czas: 35565.61 s)
Testowanie Z2 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=0.1: 0.3980 (czas: 52643.85 s)
Testowanie Z2 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=1.0: 0.5406 (czas: 52874.29 s)
Testowanie Z2 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=10.0: 0.5663 (czas: 52586.34 s)
Najlepszy kwantowy SVM: Z2 z C=10.0, dokładność: 0.5663
Raport klasyfikacji (najlepszy kwantowy SVM):
precision recall f1-score support
-- 0.00 0.00 0.00 8
Astrocytoma, NOS 0.75 0.22 0.34 27
Astrocytoma, anaplastic 0.87 0.24 0.38 82
Glioblastoma 0.51 1.00 0.67 219
Mixed glioma 0.85 0.43 0.57 65
Oligodendroglioma, NOS 0.93 0.20 0.33 71
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 0.17 0.30 46
accuracy 0.57 518
macro avg 0.70 0.32 0.37 518
weighted avg 0.71 0.57 0.51 518
Szczegółowe metryki dla modelu Kwantowy SVM Z2:
Accuracy: 0.5695
Precision: 0.7148
Recall: 0.5695
F1 Score: 0.5057
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 0 0 1 7 0 0 0]
[ 0 6 0 17 4 0 0]
[ 0 0 20 60 1 1 0]
[ 0 0 0 219 0 0 0]
[ 0 0 0 37 28 0 0]
[ 0 0 2 55 0 14 0]
[ 0 2 0 36 0 0 8]]
Całkowity czas dla kwantowego SVM: 279267.18 sekund
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
Klasyczny SVM: 1.0000
Kwantowy SVM: 0.5695
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3124
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1562
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1392
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1276
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0907
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0568
Czas analizy znaczenia cech: 806.96 sekund
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU Z =======
Data i czas zakończenia: 2025-08-18 11:47:22
Całkowity czas eksperymentu: 1755510442.73 sekund

105
wyniki/eksperyment_glowny/1/z_10percent_substituted.txt Normal file
View File

@ -0,0 +1,105 @@
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
precision recall f1-score support
-- 1.00 1.00 1.00 6
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 20
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 45
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 100
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 34
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 31
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 23
accuracy 1.00 259
macro avg 1.00 1.00 1.00 259
weighted avg 1.00 1.00 1.00 259
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
Accuracy: 1.0000
Precision: 1.0000
Recall: 1.0000
F1 Score: 1.0000
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 6 0 0 0 0 0 0]
[ 0 20 0 0 0 0 0]
[ 0 0 45 0 0 0 0]
[ 0 0 0 100 0 0 0]
[ 0 0 0 0 34 0 0]
[ 0 0 0 0 0 31 0]
[ 0 0 0 0 0 0 23]]
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 17.79 sekund
======= KWANTOWY SVM Z Z FEATURE MAPS =======
Testowanie 2 map cech: ['Z1', 'Z2']
Testowanie Z1 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=0.1: 0.3784 (czas: 9179.35 s)
Testowanie Z1 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=1.0: 0.3916 (czas: 8901.27 s)
Testowanie Z1 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=10.0: 0.3949 (czas: 8897.09 s)
Testowanie Z2 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=0.1: 0.3784 (czas: 13195.48 s)
Testowanie Z2 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=1.0: 0.3933 (czas: 13108.34 s)
Testowanie Z2 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=10.0: 0.3999 (czas: 13114.67 s)
Najlepszy kwantowy SVM: Z2 z C=10.0, dokładność: 0.3999
Raport klasyfikacji (najlepszy kwantowy SVM):
precision recall f1-score support
-- 0.00 0.00 0.00 6
Astrocytoma, NOS 0.00 0.00 0.00 20
Astrocytoma, anaplastic 1.00 0.02 0.04 45
Glioblastoma 0.40 0.99 0.57 100
Mixed glioma 0.80 0.12 0.21 34
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.13 0.23 31
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 0.09 0.16 23
accuracy 0.42 259
macro avg 0.60 0.19 0.17 259
weighted avg 0.64 0.42 0.30 259
Szczegółowe metryki dla modelu Kwantowy SVM Z2:
Accuracy: 0.4247
Precision: 0.6420
Recall: 0.4247
F1 Score: 0.2964
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 0 0 0 6 0 0 0]
[ 0 0 0 20 0 0 0]
[ 0 0 1 44 0 0 0]
[ 0 0 0 99 1 0 0]
[ 0 0 0 30 4 0 0]
[ 0 0 0 27 0 4 0]
[ 0 0 0 21 0 0 2]]
Całkowity czas dla kwantowego SVM: 68867.80 sekund
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
Klasyczny SVM: 1.0000
Kwantowy SVM: 0.4247
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3660
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1834
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1548
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1402
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0977
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0846
Czas analizy znaczenia cech: 284.69 sekund
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU Z =======
Data i czas zakończenia: 2025-08-27 08:42:32
Całkowity czas eksperymentu: 1756276952.65 sekund

105
wyniki/eksperyment_glowny/1/z_15percent_added.txt Normal file
View File

@ -0,0 +1,105 @@
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 0.1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
precision recall f1-score support
-- 1.00 1.00 1.00 8
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 25
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 90
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 210
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 65
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 77
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 43
accuracy 1.00 518
macro avg 1.00 1.00 1.00 518
weighted avg 1.00 1.00 1.00 518
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
Accuracy: 1.0000
Precision: 1.0000
Recall: 1.0000
F1 Score: 1.0000
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 8 0 0 0 0 0 0]
[ 0 25 0 0 0 0 0]
[ 0 0 90 0 0 0 0]
[ 0 0 0 210 0 0 0]
[ 0 0 0 0 65 0 0]
[ 0 0 0 0 0 77 0]
[ 0 0 0 0 0 0 43]]
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 63.30 sekund
======= KWANTOWY SVM Z Z FEATURE MAPS =======
Testowanie 2 map cech: ['Z1', 'Z2']
Testowanie Z1 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=0.1: 0.3922 (czas: 35808.53 s)
Testowanie Z1 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=1.0: 0.4594 (czas: 35731.73 s)
Testowanie Z1 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=10.0: 0.4859 (czas: 36072.49 s)
Testowanie Z2 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=0.1: 0.3922 (czas: 53056.58 s)
Testowanie Z2 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=1.0: 0.4834 (czas: 56823.01 s)
Testowanie Z2 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=10.0: 0.5075 (czas: 53743.20 s)
Najlepszy kwantowy SVM: Z2 z C=10.0, dokładność: 0.5075
Raport klasyfikacji (najlepszy kwantowy SVM):
precision recall f1-score support
-- 0.00 0.00 0.00 8
Astrocytoma, NOS 1.00 0.20 0.33 25
Astrocytoma, anaplastic 0.88 0.23 0.37 90
Glioblastoma 0.46 0.99 0.63 210
Mixed glioma 0.64 0.22 0.32 65
Oligodendroglioma, NOS 0.73 0.14 0.24 77
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 0.14 0.24 43
accuracy 0.51 518
macro avg 0.67 0.27 0.31 518
weighted avg 0.66 0.51 0.43 518
Szczegółowe metryki dla modelu Kwantowy SVM Z2:
Accuracy: 0.5097
Precision: 0.6603
Recall: 0.5097
F1 Score: 0.4322
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 0 0 0 7 1 0 0]
[ 0 5 0 20 0 0 0]
[ 0 0 21 65 2 2 0]
[ 0 0 2 207 1 0 0]
[ 0 0 0 50 14 1 0]
[ 0 0 0 65 1 11 0]
[ 0 0 1 32 3 1 6]]
Całkowity czas dla kwantowego SVM: 281175.14 sekund
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
Klasyczny SVM: 1.0000
Kwantowy SVM: 0.5097
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3181
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1720
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1473
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1286
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0927
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0508
Czas analizy znaczenia cech: 819.12 sekund
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU Z =======
Data i czas zakończenia: 2025-08-21 18:08:20
Całkowity czas eksperymentu: 1755792500.58 sekund

54
wyniki/eksperyment_glowny/1/z_5percent_added.txt Normal file
View File

@ -0,0 +1,54 @@
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
Dokładność klasycznego SVM: 0.9983402489626556
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
precision recall f1-score support
-- 1.00 1.00 1.00 2
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 27
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 84
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 220
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 69
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 73
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 43
accuracy 1.00 518
macro avg 1.00 1.00 1.00 518
weighted avg 1.00 1.00 1.00 518
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
Accuracy: 1.0000
Precision: 1.0000
Recall: 1.0000
F1 Score: 1.0000
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 2 0 0 0 0 0 0]
[ 0 27 0 0 0 0 0]
[ 0 0 84 0 0 0 0]
[ 0 0 0 220 0 0 0]
[ 0 0 0 0 69 0 0]
[ 0 0 0 0 0 73 0]
[ 0 0 0 0 0 0 43]]
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 51.54 sekund
======= KWANTOWY SVM Z Z FEATURE MAPS =======
Testowanie 2 map cech: ['Z1', 'Z2']
Testowanie Z1 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=0.1: 0.4453 (czas: 35561.63 s)
Testowanie Z1 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=1.0: 0.6219 (czas: 35746.35 s)
Testowanie Z1 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=10.0: 0.6551 (czas: 35656.26 s)
Testowanie Z2 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=0.1: 0.4378 (czas: 52562.44 s)
Testowanie Z2 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=1.0: 0.6468 (czas: 52641.36 s)
Testowanie Z2 z C=10.0...
======= PRZEKROCZONO MAKSYMALNY CZAS WYKONANIA =======
Eksperyment został przerwany po 168.0 godzinach.

105
wyniki/eksperyment_glowny/1/z_5percent_substituted.txt Normal file
View File

@ -0,0 +1,105 @@
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
precision recall f1-score support
-- 1.00 1.00 1.00 2
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 18
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 49
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 103
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 34
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 30
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 23
accuracy 1.00 259
macro avg 1.00 1.00 1.00 259
weighted avg 1.00 1.00 1.00 259
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
Accuracy: 1.0000
Precision: 1.0000
Recall: 1.0000
F1 Score: 1.0000
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 2 0 0 0 0 0 0]
[ 0 18 0 0 0 0 0]
[ 0 0 49 0 0 0 0]
[ 0 0 0 103 0 0 0]
[ 0 0 0 0 34 0 0]
[ 0 0 0 0 0 30 0]
[ 0 0 0 0 0 0 23]]
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 22.76 sekund
======= KWANTOWY SVM Z Z FEATURE MAPS =======
Testowanie 2 map cech: ['Z1', 'Z2']
Testowanie Z1 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=0.1: 0.4000 (czas: 9150.96 s)
Testowanie Z1 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=1.0: 0.4696 (czas: 9263.03 s)
Testowanie Z1 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z1, C=10.0: 0.4746 (czas: 8923.60 s)
Testowanie Z2 z C=0.1...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=0.1: 0.4000 (czas: 13149.62 s)
Testowanie Z2 z C=1.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=1.0: 0.4713 (czas: 13207.41 s)
Testowanie Z2 z C=10.0...
Dokładność kwantowego SVM z Z2, C=10.0: 0.4862 (czas: 13416.89 s)
Najlepszy kwantowy SVM: Z2 z C=10.0, dokładność: 0.4862
Raport klasyfikacji (najlepszy kwantowy SVM):
precision recall f1-score support
-- 0.00 0.00 0.00 2
Astrocytoma, NOS 1.00 0.22 0.36 18
Astrocytoma, anaplastic 1.00 0.08 0.15 49
Glioblastoma 0.44 1.00 0.61 103
Mixed glioma 0.90 0.26 0.41 34
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.13 0.24 30
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 0.09 0.16 23
accuracy 0.49 259
macro avg 0.76 0.26 0.28 259
weighted avg 0.76 0.49 0.39 259
Szczegółowe metryki dla modelu Kwantowy SVM Z2:
Accuracy: 0.4865
Precision: 0.7558
Recall: 0.4865
F1 Score: 0.3914
ROC AUC: N/A
Macierz pomyłek:
[[ 0 0 0 2 0 0 0]
[ 0 4 0 14 0 0 0]
[ 0 0 4 44 1 0 0]
[ 0 0 0 103 0 0 0]
[ 0 0 0 25 9 0 0]
[ 0 0 0 26 0 4 0]
[ 0 0 0 21 0 0 2]]
Całkowity czas dla kwantowego SVM: 69630.55 sekund
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
Klasyczny SVM: 1.0000
Kwantowy SVM: 0.4865
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3398
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1919
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1548
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1293
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0958
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0764
Czas analizy znaczenia cech: 274.49 sekund
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU Z =======
Data i czas zakończenia: 2025-08-26 13:29:42
Całkowity czas eksperymentu: 1756207782.23 sekund