======= INFORMACJE O ŚRODOWISKU ======= Data i czas rozpoczęcia: 2025-08-20 15:33:20 Wersja NumPy: 1.24.3 Wersja Pandas: 2.0.3 Wersja scikit-learn: 1.3.0 Wersja Qiskit: 0.25.1 Wersja qiskit-machine-learning: 0.6.0 Wersja dimod: 0.12.20 Wersja neal: 0.6.0 ======= WYBRANE EKSPERYMENTY ======= Eksperyment 1 (Wpływ złożoności danych): TAK Eksperyment 2 (Podzbiory genów): TAK Eksperyment 3 (Mapowania cech): TAK ======= WCZYTYWANIE DANYCH ======= Czas wczytywania danych: 0.01 sekund Wymiary danych: (858, 27) ======= STRUKTURA DANYCH ======= Kolumny w zbiorze danych: ['Grade', 'Project', 'Case_ID', 'Gender', 'Age_at_diagnosis']... Typy danych w kolumnach: Grade object Project object Case_ID object Gender object Age_at_diagnosis object dtype: object Przykładowe dane: Grade Project Case_ID Gender ... GRIN2A IDH2 FAT4 PDGFRA 0 LGG TCGA-LGG TCGA-DU-8164 Male ... NOT_MUTATED NOT_MUTATED NOT_MUTATED NOT_MUTATED 1 LGG TCGA-LGG TCGA-QH-A6CY Male ... NOT_MUTATED NOT_MUTATED NOT_MUTATED NOT_MUTATED [2 rows x 27 columns] Unikalne wartości w kolumnie 'Primary_Diagnosis': ['Oligodendroglioma, NOS' 'Mixed glioma' 'Astrocytoma, NOS' 'Astrocytoma, anaplastic' 'Oligodendroglioma, anaplastic' 'Glioblastoma'] Liczba próbek dla każdej klasy: Primary_Diagnosis Glioblastoma 360 Astrocytoma, anaplastic 129 Mixed glioma 128 Oligodendroglioma, NOS 108 Oligodendroglioma, anaplastic 75 Astrocytoma, NOS 58 Name: count, dtype: int64 ======= PRZYGOTOWANIE DANYCH DO EKSPERYMENTÓW ======= Przykładowe wartości w kolumnach genów: ['MUTATED' 'NOT_MUTATED' 'NOT_MUTATED' 'NOT_MUTATED' 'NOT_MUTATED'] Wybrana zmienna docelowa: Primary_Diagnosis Unikalne wartości w kolumnie 'Primary_Diagnosis': ['Oligodendroglioma, NOS' 'Mixed glioma' 'Astrocytoma, NOS' 'Astrocytoma, anaplastic' 'Oligodendroglioma, anaplastic' 'Glioblastoma'] Liczba próbek dla każdej klasy: Primary_Diagnosis Glioblastoma 360 Astrocytoma, anaplastic 129 Mixed glioma 128 Oligodendroglioma, NOS 108 Oligodendroglioma, anaplastic 75 Astrocytoma, NOS 58 Name: count, dtype: int64 Średnia liczba mutacji na przypadek: 2.29 Mediana liczby mutacji: 2.00 Min/Max liczby mutacji: 0/17 ======= EKSPERYMENT 1: WPŁYW ZŁOŻONOŚCI DANYCH ======= Poziomy złożoności danych: Low Complexity: 250 przypadków Średnia liczba mutacji: 0.72 Medium Complexity: 230 przypadków Średnia liczba mutacji: 2.00 High Complexity: 378 przypadków Średnia liczba mutacji: 3.50 Testowanie poziomu złożoności: Low Complexity Aktywne mapy cech: ['Amplitude_l2_C1', 'Amplitude_l1_C1', 'Amplitude_min-max_C1'] Testowanie mapy cech: Amplitude_l2_C1 Dokładność: 0.7600 Testowanie mapy cech: Amplitude_l1_C1 Dokładność: 0.7600 Testowanie mapy cech: Amplitude_min-max_C1 Dokładność: 0.7600 Linear SVM: 0.7600 RBF SVM: 0.7600 Best Quantum SVM: 0.7600 (Amplitude_l2_C1) Testowanie poziomu złożoności: Medium Complexity Aktywne mapy cech: ['Amplitude_l2_C1', 'Amplitude_l1_C1', 'Amplitude_min-max_C1'] Testowanie mapy cech: Amplitude_l2_C1 Dokładność: 0.6232 Testowanie mapy cech: Amplitude_l1_C1 Dokładność: 0.6232 Testowanie mapy cech: Amplitude_min-max_C1 Dokładność: 0.6232 Linear SVM: 0.5797 RBF SVM: 0.5942 Best Quantum SVM: 0.6232 (Amplitude_l2_C1) Testowanie poziomu złożoności: High Complexity Aktywne mapy cech: ['Amplitude_l2_C1', 'Amplitude_l1_C1', 'Amplitude_min-max_C1'] Testowanie mapy cech: Amplitude_l2_C1 Dokładność: 0.3333 Testowanie mapy cech: Amplitude_l1_C1 Dokładność: 0.3333 Testowanie mapy cech: Amplitude_min-max_C1 Dokładność: 0.3333 Linear SVM: 0.3509 RBF SVM: 0.3421 Best Quantum SVM: 0.3333 (Amplitude_l2_C1) Czas wykonania eksperymentu złożoności: 32054.69 sekund Wyniki zapisane do pliku: wyniki/eksperymenty_poboczne-1/wyniki_eksperymentu_zlozonosc.csv ======= EKSPERYMENT 2: PODZBIORY GENÓW ======= Liczba genów w każdym podzbiorze: Wszystkie geny: 20 genów (dostępne: 20, brakujące: 0) Geny często mutowane: 4 genów (dostępne: 4, brakujące: 0) Geny średnio mutowane: 7 genów (dostępne: 7, brakujące: 0) Geny rzadko mutowane: 8 genów (dostępne: 8, brakujące: 0) Testing gene subset: Wszystkie geny (n=all) Testing ZZ1, C=10.0 Accuracy: 0.5388 Testing ZZ2, C=0.1 Accuracy: 0.4690 Testing Pauli1, C=10.0 Accuracy: 0.5349 Linear SVM: 0.5426 RBF SVM: 0.5349 Best Quantum SVM: 0.5388 (ZZ1_C10) Testing gene subset: Geny często mutowane (n=4) Testing ZZ1, C=10.0 Accuracy: 0.5426 Testing ZZ2, C=0.1 Accuracy: 0.5426 Testing Pauli1, C=10.0 Accuracy: 0.5194 Linear SVM: 0.5426 RBF SVM: 0.5543 Best Quantum SVM: 0.5426 (ZZ1_C10) Testing gene subset: Geny średnio mutowane (n=7) Testing ZZ1, C=10.0 Accuracy: 0.4341 Testing ZZ2, C=0.1 Accuracy: 0.4612 Testing Pauli1, C=10.0 Accuracy: 0.3992 Linear SVM: 0.4651 RBF SVM: 0.4690 Best Quantum SVM: 0.4612 (ZZ2_C01) Testing gene subset: Geny rzadko mutowane (n=8) Testing ZZ1, C=10.0 Accuracy: 0.4264 Testing ZZ2, C=0.1 Accuracy: 0.4225 Testing Pauli1, C=10.0 Accuracy: 0.4264 Linear SVM: 0.4225 RBF SVM: 0.4341 Best Quantum SVM: 0.4264 (ZZ1_C10) Czas wykonania eksperymentu podzbiorów genów: 96842.45 sekund Wyniki zapisane do pliku: wyniki/eksperymenty_poboczne-1/wyniki_eksperymentu_geny.csv ======= EKSPERYMENT 3: MAPOWANIA CECH ======= Aktywne mapy cech: ['Amplitude_l2_C1', 'Amplitude_l1_C1', 'Amplitude_min-max_C1'] Dokładność klasycznego SVM (RBF): 0.5504 Testowanie mapowania: Amplitude_l2_C1 Dokładność: 0.5349 Właściwości macierzy jądra: śr=0.069, std=0.250, min=-0.000, max=1.002 Testowanie mapowania: Amplitude_l1_C1 Dokładność: 0.5426 Właściwości macierzy jądra: śr=0.043, std=0.197, min=-0.000, max=1.002 Testowanie mapowania: Amplitude_min-max_C1 Dokładność: 0.5388 Właściwości macierzy jądra: śr=0.061, std=0.236, min=-0.000, max=1.003 Najlepsze mapowanie kwantowe: Amplitude_l1_C1 (dokładność: 0.5426) Różnica względem klasycznego SVM: -0.0078 Czas wykonania eksperymentu mapowania cech: 93077.23 sekund Wyniki zapisane do pliku: wyniki/eksperymenty_poboczne-1/wyniki_eksperymentu_mapowania.csv ======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTÓW ======= Całkowity czas wykonania eksperymentów: 221974.37 sekund (3699.57 minut) Wyniki eksperymentu złożoności danych: linear_svm rbf_svm ... Amplitude_l1_C1 Amplitude_min-max_C1 Low Complexity 0.76 0.76 ... 0.76 0.76 Medium Complexity 0.57971 0.594203 ... 0.623188 0.623188 High Complexity 0.350877 0.342105 ... 0.333333 0.333333 [3 rows x 7 columns] Wyniki eksperymentu podzbiorów genów: linear_svm rbf_svm ... Pauli1_C10 sample_size Wszystkie geny 0.542636 0.534884 ... 0.534884 20 Geny często mutowane 0.542636 0.554264 ... 0.51938 4 Geny średnio mutowane 0.465116 0.468992 ... 0.399225 7 Geny rzadko mutowane 0.422481 0.434109 ... 0.426357 8 [4 rows x 8 columns] Wyniki eksperymentu mapowania cech: accuracy Amplitude_l2_C1 0.534884 Amplitude_l1_C1 0.542636 Amplitude_min-max_C1 0.538760 Wszystkie wyniki zostały zapisane w katalogu: wyniki/eksperymenty_poboczne-1