Upload files to "wyniki/eksperyment_glowny/1"
This commit is contained in:
parent
c5a3318759
commit
250bf7ac3a
|
|
@ -0,0 +1,133 @@
|
|||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 0.1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 1.00 1.00 1.00 8
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 25
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 90
|
||||
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 210
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 65
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 77
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 43
|
||||
|
||||
accuracy 1.00 518
|
||||
macro avg 1.00 1.00 1.00 518
|
||||
weighted avg 1.00 1.00 1.00 518
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
|
||||
Accuracy: 1.0000
|
||||
Precision: 1.0000
|
||||
Recall: 1.0000
|
||||
F1 Score: 1.0000
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 8 0 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 25 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 90 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 210 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 65 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 77 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 0 43]]
|
||||
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 61.53 sekund
|
||||
|
||||
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||
Wczytano 9 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_amplitude_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_15percent_added.json
|
||||
Łącznie wczytano 9 wyników kwantowych
|
||||
|
||||
Wszystkie wyniki kwantowe:
|
||||
Amplitude_min-max, C=1.0: 0.9768
|
||||
Amplitude_min-max, C=0.1: 0.9718
|
||||
Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9693
|
||||
Amplitude_l2, C=10.0: 0.9544
|
||||
Amplitude_l2, C=1.0: 0.9453
|
||||
Amplitude_l2, C=0.1: 0.8706
|
||||
Amplitude_l1, C=10.0: 0.8623
|
||||
Amplitude_l1, C=1.0: 0.4055
|
||||
Amplitude_l1, C=0.1: 0.3922
|
||||
|
||||
Najlepszy wynik: Amplitude_min-max z C=1.0, score=0.9768
|
||||
|
||||
======= WYŻARZANIE SYMULOWANE =======
|
||||
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania symulowanego...
|
||||
Czas wyżarzania symulowanego: 8.35 sekund
|
||||
Optymalne hiperparametry z wyżarzania symulowanego: feature_map=Z1, C=10.0
|
||||
Czas trenowania modelu hybrydowego: 3703.00 sekund
|
||||
Czas ewaluacji modelu hybrydowego: 3099.57 sekund
|
||||
Dokładność ostatecznego modelu hybrydowego: 0.5039
|
||||
Raport klasyfikacji (model hybrydowy):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 0.00 0.00 0.00 8
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 0.20 0.33 25
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 0.16 0.27 90
|
||||
Glioblastoma 0.45 1.00 0.62 210
|
||||
Mixed glioma 1.00 0.22 0.35 65
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.17 0.29 77
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 0.12 0.21 43
|
||||
|
||||
accuracy 0.50 518
|
||||
macro avg 0.78 0.27 0.30 518
|
||||
weighted avg 0.76 0.50 0.42 518
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Model hybrydowy:
|
||||
Accuracy: 0.5039
|
||||
Precision: 0.7615
|
||||
Recall: 0.5039
|
||||
F1 Score: 0.4191
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 0 0 0 8 0 0 0]
|
||||
[ 0 5 0 20 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 14 76 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 210 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 51 14 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 64 0 13 0]
|
||||
[ 0 0 0 38 0 0 5]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 6810.95 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 1.0000
|
||||
Model hybrydowy: 0.5039
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3181
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1720
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1473
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1286
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0927
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0508
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 850.48 sekund
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU HYBRYDOWEGO =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-15 09:09:16
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 1755241756.68 sekund
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,98 @@
|
|||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 1.00 1.00 1.00 3
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 21
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 42
|
||||
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 90
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 39
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 37
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 27
|
||||
|
||||
accuracy 1.00 259
|
||||
macro avg 1.00 1.00 1.00 259
|
||||
weighted avg 1.00 1.00 1.00 259
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
|
||||
Accuracy: 1.0000
|
||||
Precision: 1.0000
|
||||
Recall: 1.0000
|
||||
F1 Score: 1.0000
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 3 0 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 21 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 42 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 90 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 39 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 37 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 0 27]]
|
||||
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 21.10 sekund
|
||||
|
||||
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||
Wczytano 9 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_amplitude_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_15percent_substituted.json
|
||||
Łącznie wczytano 9 wyników kwantowych
|
||||
|
||||
Wszystkie wyniki kwantowe:
|
||||
Amplitude_min-max, C=1.0: 0.9602
|
||||
Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9552
|
||||
Amplitude_min-max, C=0.1: 0.9520
|
||||
Amplitude_l2, C=1.0: 0.8839
|
||||
Amplitude_l2, C=10.0: 0.8625
|
||||
Amplitude_l1, C=10.0: 0.6337
|
||||
Amplitude_l2, C=0.1: 0.5989
|
||||
Amplitude_l1, C=0.1: 0.3651
|
||||
Amplitude_l1, C=1.0: 0.3651
|
||||
|
||||
Najlepszy wynik: Amplitude_min-max z C=1.0, score=0.9602
|
||||
|
||||
======= WYŻARZANIE SYMULOWANE =======
|
||||
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania symulowanego...
|
||||
Czas wyżarzania symulowanego: 8.78 sekund
|
||||
Nie znaleziono optymalnego rozwiązania w wyżarzaniu symulowanym.
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 8.78 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 1.0000
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3548
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1780
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1764
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1683
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.1143
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0869
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 284.62 sekund
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU HYBRYDOWEGO =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-15 17:39:34
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 1755272374.63 sekund
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,133 @@
|
|||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 0.1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 1.00 1.00 1.00 8
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 32
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 79
|
||||
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 203
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 69
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 76
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 51
|
||||
|
||||
accuracy 1.00 518
|
||||
macro avg 1.00 1.00 1.00 518
|
||||
weighted avg 1.00 1.00 1.00 518
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
|
||||
Accuracy: 1.0000
|
||||
Precision: 1.0000
|
||||
Recall: 1.0000
|
||||
F1 Score: 1.0000
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 8 0 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 32 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 79 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 203 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 69 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 76 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 0 51]]
|
||||
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 63.66 sekund
|
||||
|
||||
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||
Wczytano 9 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_amplitude_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_20percent_added.json
|
||||
Łącznie wczytano 9 wyników kwantowych
|
||||
|
||||
Wszystkie wyniki kwantowe:
|
||||
Amplitude_min-max, C=1.0: 0.9718
|
||||
Amplitude_min-max, C=0.1: 0.9635
|
||||
Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9610
|
||||
Amplitude_l2, C=1.0: 0.9536
|
||||
Amplitude_l2, C=10.0: 0.9519
|
||||
Amplitude_l1, C=10.0: 0.8681
|
||||
Amplitude_l2, C=0.1: 0.8615
|
||||
Amplitude_l1, C=1.0: 0.3881
|
||||
Amplitude_l1, C=0.1: 0.3873
|
||||
|
||||
Najlepszy wynik: Amplitude_min-max z C=1.0, score=0.9718
|
||||
|
||||
======= WYŻARZANIE SYMULOWANE =======
|
||||
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania symulowanego...
|
||||
Czas wyżarzania symulowanego: 8.35 sekund
|
||||
Optymalne hiperparametry z wyżarzania symulowanego: feature_map=Z1, C=10.0
|
||||
Czas trenowania modelu hybrydowego: 3832.64 sekund
|
||||
Czas ewaluacji modelu hybrydowego: 3412.17 sekund
|
||||
Dokładność ostatecznego modelu hybrydowego: 0.4653
|
||||
Raport klasyfikacji (model hybrydowy):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 0.00 0.00 0.00 8
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 0.19 0.32 32
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 0.18 0.30 79
|
||||
Glioblastoma 0.42 1.00 0.59 203
|
||||
Mixed glioma 1.00 0.14 0.25 69
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.08 0.15 76
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 0.04 0.08 51
|
||||
|
||||
accuracy 0.47 518
|
||||
macro avg 0.77 0.23 0.24 518
|
||||
weighted avg 0.76 0.47 0.36 518
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Model hybrydowy:
|
||||
Accuracy: 0.4653
|
||||
Precision: 0.7584
|
||||
Recall: 0.4653
|
||||
F1 Score: 0.3610
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 0 0 0 8 0 0 0]
|
||||
[ 0 6 0 26 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 14 65 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 203 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 59 10 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 70 0 6 0]
|
||||
[ 0 0 0 49 0 0 2]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 7253.20 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 1.0000
|
||||
Model hybrydowy: 0.4653
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3268
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1573
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1448
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1434
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.1087
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.0651
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 902.30 sekund
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU HYBRYDOWEGO =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-15 11:26:16
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 1755249976.04 sekund
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,133 @@
|
|||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 1.00 1.00 1.00 7
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 24
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 46
|
||||
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 94
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 31
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 24
|
||||
|
||||
accuracy 1.00 259
|
||||
macro avg 1.00 1.00 1.00 259
|
||||
weighted avg 1.00 1.00 1.00 259
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
|
||||
Accuracy: 1.0000
|
||||
Precision: 1.0000
|
||||
Recall: 1.0000
|
||||
F1 Score: 1.0000
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 7 0 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 24 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 46 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 94 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 31 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 33 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 0 24]]
|
||||
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 21.28 sekund
|
||||
|
||||
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||
Wczytano 9 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_amplitude_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_noise_20percent_substituted.json
|
||||
Łącznie wczytano 9 wyników kwantowych
|
||||
|
||||
Wszystkie wyniki kwantowe:
|
||||
Amplitude_min-max, C=0.1: 0.9585
|
||||
Amplitude_min-max, C=1.0: 0.9519
|
||||
Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9435
|
||||
Amplitude_l2, C=1.0: 0.8939
|
||||
Amplitude_l2, C=10.0: 0.8755
|
||||
Amplitude_l1, C=10.0: 0.6518
|
||||
Amplitude_l2, C=0.1: 0.5822
|
||||
Amplitude_l1, C=0.1: 0.3518
|
||||
Amplitude_l1, C=1.0: 0.3518
|
||||
|
||||
Najlepszy wynik: Amplitude_min-max z C=0.1, score=0.9585
|
||||
|
||||
======= WYŻARZANIE SYMULOWANE =======
|
||||
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania symulowanego...
|
||||
Czas wyżarzania symulowanego: 8.34 sekund
|
||||
Optymalne hiperparametry z wyżarzania symulowanego: feature_map=ZZ2, C=0.1
|
||||
Czas trenowania modelu hybrydowego: 7804.22 sekund
|
||||
Czas ewaluacji modelu hybrydowego: 6654.54 sekund
|
||||
Dokładność ostatecznego modelu hybrydowego: 0.3629
|
||||
Raport klasyfikacji (model hybrydowy):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
-- 0.00 0.00 0.00 7
|
||||
Astrocytoma, NOS 0.00 0.00 0.00 24
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 0.00 0.00 0.00 46
|
||||
Glioblastoma 0.36 1.00 0.53 94
|
||||
Mixed glioma 0.00 0.00 0.00 31
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 0.00 0.00 0.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 0.00 0.00 0.00 24
|
||||
|
||||
accuracy 0.36 259
|
||||
macro avg 0.05 0.14 0.08 259
|
||||
weighted avg 0.13 0.36 0.19 259
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Model hybrydowy:
|
||||
Accuracy: 0.3629
|
||||
Precision: 0.1317
|
||||
Recall: 0.3629
|
||||
F1 Score: 0.1933
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 0 0 0 7 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 24 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 46 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 94 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 31 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 33 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 24 0 0 0]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 14467.17 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 1.0000
|
||||
Model hybrydowy: 0.3629
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3977
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.2104
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1544
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1475
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.1131
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, NOS: 0.1035
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 266.92 sekund
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU HYBRYDOWEGO =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-15 21:45:30
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 1755287130.16 sekund
|
||||
|
|
@ -0,0 +1,132 @@
|
|||
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||
Najlepsze parametry klasycznego SVM: {'C': 0.1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||
Dokładność klasycznego SVM: 1.0
|
||||
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 1.00 1.00 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 42
|
||||
Glioblastoma 1.00 1.00 1.00 109
|
||||
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||
|
||||
accuracy 1.00 258
|
||||
macro avg 1.00 1.00 1.00 258
|
||||
weighted avg 1.00 1.00 1.00 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM:
|
||||
Accuracy: 1.0000
|
||||
Precision: 1.0000
|
||||
Recall: 1.0000
|
||||
F1 Score: 1.0000
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 19 0 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 109 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 38 0 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||
|
||||
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM: 17.97 sekund
|
||||
|
||||
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||
Wczytano 3 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_zz_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_all.json
|
||||
Wczytano 9 wyników z wyniki/2025-08-04-dim_reduction-10-fold/qsvm_amplitude_cache_TCGA_GBM_LGG_Mutations_all.json
|
||||
Łącznie wczytano 12 wyników kwantowych
|
||||
|
||||
Wszystkie wyniki kwantowe:
|
||||
Amplitude_min-max, C=1.0: 0.9767
|
||||
Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9767
|
||||
Amplitude_min-max, C=0.1: 0.9583
|
||||
Amplitude_l2, C=10.0: 0.9333
|
||||
Amplitude_l2, C=1.0: 0.9117
|
||||
Amplitude_l1, C=10.0: 0.8000
|
||||
Amplitude_l2, C=0.1: 0.7650
|
||||
ZZ1, C=10.0: 0.4950
|
||||
ZZ1, C=1.0: 0.4633
|
||||
ZZ1, C=0.1: 0.4183
|
||||
Amplitude_l1, C=0.1: 0.4183
|
||||
Amplitude_l1, C=1.0: 0.4183
|
||||
|
||||
Najlepszy wynik: Amplitude_min-max z C=1.0, score=0.9767
|
||||
|
||||
======= WYŻARZANIE SYMULOWANE =======
|
||||
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=0.1: 0.4183
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=1.0: 0.4633
|
||||
Wynik dla ZZ1, C=10.0: 0.4950
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla ZZ2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Pauli2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z1, C=10.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=0.1: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=1.0: 0.0000
|
||||
Wynik dla Z2, C=10.0: 0.0000
|
||||
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania symulowanego...
|
||||
Czas wyżarzania symulowanego: 9.07 sekund
|
||||
Optymalne hiperparametry z wyżarzania symulowanego: feature_map=ZZ1, C=10.0
|
||||
Czas trenowania modelu hybrydowego: 4402.55 sekund
|
||||
Czas ewaluacji modelu hybrydowego: 3551.13 sekund
|
||||
Dokładność ostatecznego modelu hybrydowego: 0.5581
|
||||
Raport klasyfikacji (model hybrydowy):
|
||||
precision recall f1-score support
|
||||
|
||||
Astrocytoma, NOS 1.00 0.16 0.27 19
|
||||
Astrocytoma, anaplastic 1.00 0.21 0.35 42
|
||||
Glioblastoma 0.49 1.00 0.66 109
|
||||
Mixed glioma 1.00 0.45 0.62 38
|
||||
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.18 0.31 33
|
||||
Oligodendroglioma, anaplastic 0.00 0.00 0.00 17
|
||||
|
||||
accuracy 0.56 258
|
||||
macro avg 0.75 0.33 0.37 258
|
||||
weighted avg 0.72 0.56 0.49 258
|
||||
|
||||
|
||||
Szczegółowe metryki dla modelu Model hybrydowy:
|
||||
Accuracy: 0.5581
|
||||
Precision: 0.7181
|
||||
Recall: 0.5581
|
||||
F1 Score: 0.4854
|
||||
ROC AUC: N/A
|
||||
|
||||
Macierz pomyłek:
|
||||
[[ 3 0 16 0 0 0]
|
||||
[ 0 9 33 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 109 0 0 0]
|
||||
[ 0 0 21 17 0 0]
|
||||
[ 0 0 27 0 6 0]
|
||||
[ 0 0 17 0 0 0]]
|
||||
|
||||
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 7962.80 sekund
|
||||
|
||||
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||
Klasyczny SVM: 1.0000
|
||||
Model hybrydowy: 0.5581
|
||||
|
||||
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.3267
|
||||
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.1795
|
||||
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.1628
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.1419
|
||||
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.0709
|
||||
|
||||
Czas analizy znaczenia cech: 244.57 sekund
|
||||
|
||||
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU HYBRYDOWEGO =======
|
||||
Data i czas zakończenia: 2025-08-07 01:41:23
|
||||
Całkowity czas eksperymentu: 1754523683.35 sekund
|
||||
Loading…
Reference in New Issue