Upload files to "eksperymenty_poboczne"

eksperymenty_poboczne/run_experiment.sh

@@ -0,0 +1,84 @@
+#!/bin/bash
+
+# Skrypt do uruchomienia eksperymentu 2 w chmurze VAST.AI
+# Autor: Michał - Praca magisterska
+# Data: $(date)
+
+echo "======= URUCHAMIANIE EKSPERYMENTU 2: PODZBIORY GENÓW ======="
+echo "Data rozpoczęcia: $(date)"
+echo "Liczba dostępnych rdzeni CPU: $(nproc)"
+echo ""
+
+# Sprawdź czy plik experiments.py istnieje
+if [ ! -f "experiments.py" ]; then
+    echo "BŁĄD: Plik experiments.py nie został znaleziony!"
+    echo "Upewnij się, że jesteś w odpowiednim katalogu."
+    exit 1
+fi
+
+# Sprawdź czy katalog z danymi istnieje
+if [ ! -d "dane" ]; then
+    echo "BŁĄD: Katalog 'dane' nie został znaleziony!"
+    echo "Upewnij się, że dane zostały przesłane na serwer."
+    exit 1
+fi
+
+# Sprawdź czy plik z danymi istnieje
+if [ ! -f "dane/TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean.csv" ]; then
+    echo "BŁĄD: Plik danych TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean.csv nie został znaleziony!"
+    echo "Sprawdź czy dane zostały poprawnie przesłane."
+    exit 1
+fi
+
+echo "Wszystkie wymagane pliki zostały znalezione."
+echo ""
+
+# Sprawdź czy biblioteki są zainstalowane
+echo "Sprawdzanie instalacji bibliotek..."
+python3 -c "import numpy, pandas, sklearn, qiskit" 2>/dev/null
+if [ $? -ne 0 ]; then
+    echo "Instalowanie wymaganych bibliotek..."
+    pip install numpy pandas scikit-learn qiskit qiskit-aer qiskit-machine-learning
+    if [ $? -ne 0 ]; then
+        echo "BŁĄD: Nie udało się zainstalować bibliotek!"
+        exit 1
+    fi
+else
+    echo "Wszystkie biblioteki są zainstalowane."
+fi
+
+# Sprawdź czy qiskit-aer jest zainstalowany (wymagane dla nowszych wersji)
+echo "Sprawdzanie qiskit-aer..."
+python3 -c "import qiskit_aer" 2>/dev/null
+if [ $? -ne 0 ]; then
+    echo "Instalowanie qiskit-aer..."
+    pip install qiskit-aer
+    if [ $? -ne 0 ]; then
+        echo "OSTRZEŻENIE: Nie udało się zainstalować qiskit-aer, ale eksperyment może działać z starszą wersją Qiskit"
+    fi
+fi
+
+echo ""
+echo "Uruchamianie eksperymentu..."
+echo ""
+
+# Uruchom eksperyment
+python3 experiments.py
+
+# Sprawdź czy eksperyment zakończył się sukcesem
+if [ $? -eq 0 ]; then
+    echo ""
+    echo "======= EKSPERYMENT ZAKOŃCZONY SUKCESEM ======="
+    echo "Data zakończenia: $(date)"
+    echo ""
+    echo "Wyniki zostały zapisane w katalogu: wyniki/eksperyment_2_podzbiory_genow/"
+    echo ""
+    echo "Sprawdź pliki wyników:"
+    ls -la wyniki/eksperyment_2_podzbiory_genow/ 2>/dev/null || echo "Katalog wyników nie został utworzony."
+else
+    echo ""
+    echo "======= EKSPERYMENT ZAKOŃCZONY BŁĘDEM ======="
+    echo "Data zakończenia: $(date)"
+    echo "Sprawdź logi powyżej aby zidentyfikować problem."
+    exit 1
+fi