Upload files to "wyniki/redukcja wymiarowosci/eksperyment 2"
This commit is contained in:
parent
b26193feb8
commit
98186f6a03
|
|
@ -0,0 +1,398 @@
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"default": {
|
||||||
|
"best_params": {
|
||||||
|
"C": 100,
|
||||||
|
"gamma": 0.01,
|
||||||
|
"kernel": "rbf"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"best_score": 0.9500000000000001,
|
||||||
|
"metrics": {
|
||||||
|
"accuracy": 0.9418604651162791,
|
||||||
|
"precision": 0.9430795801020352,
|
||||||
|
"recall": 0.9418604651162791,
|
||||||
|
"f1": 0.9417604393109547,
|
||||||
|
"roc_auc": "N/A",
|
||||||
|
"confusion_matrix": [
|
||||||
|
[
|
||||||
|
15,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
40,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
3,
|
||||||
|
103,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
37,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
32,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
16
|
||||||
|
]
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"execution_time": 1.2974693775177002
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"pca_8": {
|
||||||
|
"best_params": {
|
||||||
|
"C": 100,
|
||||||
|
"gamma": 0.01,
|
||||||
|
"kernel": "rbf"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"best_score": 0.9500000000000001,
|
||||||
|
"metrics": {
|
||||||
|
"accuracy": 0.9418604651162791,
|
||||||
|
"precision": 0.9430795801020352,
|
||||||
|
"recall": 0.9418604651162791,
|
||||||
|
"f1": 0.9417604393109547,
|
||||||
|
"roc_auc": "N/A",
|
||||||
|
"confusion_matrix": [
|
||||||
|
[
|
||||||
|
15,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
40,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
3,
|
||||||
|
103,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
37,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
32,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
16
|
||||||
|
]
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"execution_time": 1.2923190593719482
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"pca_10": {
|
||||||
|
"best_params": {
|
||||||
|
"C": 10,
|
||||||
|
"gamma": 0.01,
|
||||||
|
"kernel": "rbf"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"best_score": 0.975,
|
||||||
|
"metrics": {
|
||||||
|
"accuracy": 0.9767441860465116,
|
||||||
|
"precision": 0.9769856184584866,
|
||||||
|
"recall": 0.9767441860465116,
|
||||||
|
"f1": 0.976722675775346,
|
||||||
|
"roc_auc": "N/A",
|
||||||
|
"confusion_matrix": [
|
||||||
|
[
|
||||||
|
17,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
41,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
106,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
38,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
33,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
17
|
||||||
|
]
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"execution_time": 1.2386040687561035
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"pca_12": {
|
||||||
|
"best_params": {
|
||||||
|
"C": 10,
|
||||||
|
"gamma": 0.01,
|
||||||
|
"kernel": "rbf"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"best_score": 0.9816666666666668,
|
||||||
|
"metrics": {
|
||||||
|
"accuracy": 0.9806201550387597,
|
||||||
|
"precision": 0.9809007386526767,
|
||||||
|
"recall": 0.9806201550387597,
|
||||||
|
"f1": 0.9806398000386033,
|
||||||
|
"roc_auc": "N/A",
|
||||||
|
"confusion_matrix": [
|
||||||
|
[
|
||||||
|
18,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
42,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
106,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
37,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
33,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
17
|
||||||
|
]
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"execution_time": 1.2703914642333984
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"pca_14": {
|
||||||
|
"best_params": {
|
||||||
|
"C": 0.1,
|
||||||
|
"gamma": "scale",
|
||||||
|
"kernel": "linear"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"best_score": 0.9833333333333334,
|
||||||
|
"metrics": {
|
||||||
|
"accuracy": 0.9883720930232558,
|
||||||
|
"precision": 0.9887596899224806,
|
||||||
|
"recall": 0.9883720930232558,
|
||||||
|
"f1": 0.9884953289604453,
|
||||||
|
"roc_auc": "N/A",
|
||||||
|
"confusion_matrix": [
|
||||||
|
[
|
||||||
|
18,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
42,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
108,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
37,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
33,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
17
|
||||||
|
]
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"execution_time": 1.3830502033233643
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"pca_16": {
|
||||||
|
"best_params": {
|
||||||
|
"C": 100,
|
||||||
|
"gamma": 0.01,
|
||||||
|
"kernel": "rbf"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"best_score": 0.9916666666666667,
|
||||||
|
"metrics": {
|
||||||
|
"accuracy": 0.9767441860465116,
|
||||||
|
"precision": 0.9780563106144502,
|
||||||
|
"recall": 0.9767441860465116,
|
||||||
|
"f1": 0.9770045777038696,
|
||||||
|
"roc_auc": "N/A",
|
||||||
|
"confusion_matrix": [
|
||||||
|
[
|
||||||
|
18,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
1,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
42,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
3,
|
||||||
|
2,
|
||||||
|
104,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
38,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
33,
|
||||||
|
0
|
||||||
|
],
|
||||||
|
[
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
0,
|
||||||
|
17
|
||||||
|
]
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"execution_time": 1.503495216369629
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,67 @@
|
||||||
|
[
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"method": "PCA",
|
||||||
|
"parameters": {
|
||||||
|
"n_components": 8
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"dimensions": [
|
||||||
|
858,
|
||||||
|
8
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"explained_variance": 0.4687167856431779,
|
||||||
|
"execution_time": 0.011238574981689453,
|
||||||
|
"version_name": "pca_8"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"method": "PCA",
|
||||||
|
"parameters": {
|
||||||
|
"n_components": 10
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"dimensions": [
|
||||||
|
858,
|
||||||
|
10
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"explained_variance": 0.5409859757114897,
|
||||||
|
"execution_time": 0.011492490768432617,
|
||||||
|
"version_name": "pca_10"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"method": "PCA",
|
||||||
|
"parameters": {
|
||||||
|
"n_components": 12
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"dimensions": [
|
||||||
|
858,
|
||||||
|
12
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"explained_variance": 0.6090170144380542,
|
||||||
|
"execution_time": 0.016751527786254883,
|
||||||
|
"version_name": "pca_12"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"method": "PCA",
|
||||||
|
"parameters": {
|
||||||
|
"n_components": 14
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"dimensions": [
|
||||||
|
858,
|
||||||
|
14
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"explained_variance": 0.6727583280061241,
|
||||||
|
"execution_time": 0.016129255294799805,
|
||||||
|
"version_name": "pca_14"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"method": "PCA",
|
||||||
|
"parameters": {
|
||||||
|
"n_components": 16
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"dimensions": [
|
||||||
|
858,
|
||||||
|
16
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"explained_variance": 0.7342437580434953,
|
||||||
|
"execution_time": 0.032947540283203125,
|
||||||
|
"version_name": "pca_16"
|
||||||
|
}
|
||||||
|
]
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1 @@
|
||||||
|
{"quantum_results": [["Amplitude_l2", 0.1, 0.7416666666666667], ["Amplitude_l2", 1.0, 0.8516666666666667], ["Amplitude_l2", 10.0, 0.87], ["Amplitude_l1", 0.1, 0.4183333333333334], ["Amplitude_l1", 1.0, 0.45], ["Amplitude_l1", 10.0, 0.835], ["Amplitude_min-max", 0.1, 0.79], ["Amplitude_min-max", 1.0, 0.8816666666666667], ["Amplitude_min-max", 10.0, 0.93]], "quantum_times": {"Amplitude_l2_0.1": {"total_time": 4.137783527374268, "cv_time": 4.137712717056274}, "Amplitude_l2_1.0": {"total_time": 4.097283124923706, "cv_time": 4.097202777862549}, "Amplitude_l2_10.0": {"total_time": 4.088233232498169, "cv_time": 4.088153600692749}, "Amplitude_l1_0.1": {"total_time": 4.094529867172241, "cv_time": 4.094449043273926}, "Amplitude_l1_1.0": {"total_time": 4.0805604457855225, "cv_time": 4.080477714538574}, "Amplitude_l1_10.0": {"total_time": 4.091708183288574, "cv_time": 4.091616153717041}, "Amplitude_min-max_0.1": {"total_time": 4.173805236816406, "cv_time": 4.173725128173828}, "Amplitude_min-max_1.0": {"total_time": 4.246448755264282, "cv_time": 4.246363401412964}, "Amplitude_min-max_10.0": {"total_time": 4.203169584274292, "cv_time": 4.203083753585815}}, "completed_feature_maps": [], "hybrid_scores": {}, "hybrid_eval_times": {}}
|
||||||
|
|
@ -0,0 +1,505 @@
|
||||||
|
======= ROZPOCZĘCIE EKSPERYMENTU DLA PLIKU: dane/TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean.csv =======
|
||||||
|
Wyniki będą zapisane w: wyniki/dim_reduction/23082025-clean/wyniki_svm_TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean_20250826_105344.txt
|
||||||
|
======= INFORMACJE O ŚRODOWISKU =======
|
||||||
|
Data i czas rozpoczęcia: 2025-08-26 10:53:44
|
||||||
|
Wersja NumPy: 1.24.3
|
||||||
|
Wersja Pandas: 2.0.3
|
||||||
|
Wersja scikit-learn: 1.3.0
|
||||||
|
Wersja Qiskit: 0.25.1
|
||||||
|
Wersja qiskit-machine-learning: 0.6.0
|
||||||
|
Wersja dimod: 0.12.20
|
||||||
|
Wersja neal: 0.6.0
|
||||||
|
|
||||||
|
======= WYBRANE EKSPERYMENTY =======
|
||||||
|
Klasyczny SVM: TAK
|
||||||
|
Kwantowy SVM: TAK
|
||||||
|
Podejście hybrydowe: TAK
|
||||||
|
|
||||||
|
======= AKTYWOWANE MAPY CECH =======
|
||||||
|
ZZ1: NIE
|
||||||
|
ZZ2: NIE
|
||||||
|
Pauli1: NIE
|
||||||
|
Pauli2: NIE
|
||||||
|
Z1: NIE
|
||||||
|
Z2: NIE
|
||||||
|
ZZ1_new: NIE
|
||||||
|
ZZ2_new: NIE
|
||||||
|
Amplitude_l2: TAK
|
||||||
|
Amplitude_l1: TAK
|
||||||
|
Amplitude_min-max: TAK
|
||||||
|
|
||||||
|
======= PRZYGOTOWANIE DANYCH =======
|
||||||
|
Wymiary oryginalnych danych: (858, 27)
|
||||||
|
Unikalne wartości zmiennej docelowej: ['Oligodendroglioma, NOS' 'Mixed glioma' 'Astrocytoma, NOS'
|
||||||
|
'Astrocytoma, anaplastic' 'Oligodendroglioma, anaplastic' 'Glioblastoma']
|
||||||
|
Rozkład klas: {'Glioblastoma': 360, 'Astrocytoma, anaplastic': 129, 'Mixed glioma': 128, 'Oligodendroglioma, NOS': 108, 'Oligodendroglioma, anaplastic': 75, 'Astrocytoma, NOS': 58}
|
||||||
|
Wymiary danych po usunięciu kolumn identyfikacyjnych: (858, 24)
|
||||||
|
Przekształcanie kolumn kategorycznych na binarne...
|
||||||
|
Kolumny kategoryczne do przekształcenia: ['Gender', 'Primary_Diagnosis', 'Race', 'IDH1', 'TP53', 'ATRX', 'PTEN', 'EGFR', 'CIC', 'MUC16', 'PIK3CA', 'NF1', 'PIK3R1', 'FUBP1', 'RB1', 'NOTCH1', 'BCOR', 'CSMD3', 'SMARCA4', 'GRIN2A', 'IDH2', 'FAT4', 'PDGFRA']
|
||||||
|
Kolumna Gender zawiera wartości: ['Male' 'Female']
|
||||||
|
Kolumna Primary_Diagnosis zawiera wartości: ['Oligodendroglioma, NOS' 'Mixed glioma' 'Astrocytoma, NOS'
|
||||||
|
'Astrocytoma, anaplastic' 'Oligodendroglioma, anaplastic' 'Glioblastoma']
|
||||||
|
Kolumna Primary_Diagnosis zostanie zakodowana jako one-hot.
|
||||||
|
Kolumna Race zawiera wartości: ['white' 'asian' 'black or african american' 'not reported'
|
||||||
|
'american indian or alaska native']
|
||||||
|
Kolumna Race zostanie zakodowana jako one-hot.
|
||||||
|
Kolumna IDH1 zawiera wartości: ['MUTATED' 'NOT_MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna TP53 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna ATRX zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna PTEN zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna EGFR zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna CIC zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna MUC16 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna PIK3CA zawiera wartości: ['MUTATED' 'NOT_MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna NF1 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna PIK3R1 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna FUBP1 zawiera wartości: ['MUTATED' 'NOT_MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna RB1 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna NOTCH1 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna BCOR zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna CSMD3 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna SMARCA4 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna GRIN2A zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna IDH2 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna FAT4 zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Kolumna PDGFRA zawiera wartości: ['NOT_MUTATED' 'MUTATED']
|
||||||
|
Wymiary danych po przekształceniu: (858, 31)
|
||||||
|
Wypełnianie brakujących wartości...
|
||||||
|
Wymiary danych wejściowych: (858, 31)
|
||||||
|
Wymiary danych po skalowaniu: (858, 31)
|
||||||
|
|
||||||
|
======= REDUKCJA WYMIAROWOŚCI =======
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie PCA z 8 komponentami...
|
||||||
|
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 8)
|
||||||
|
Wyjaśniona wariancja: 0.4687
|
||||||
|
Czas wykonania PCA: 0.01 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie PCA z 10 komponentami...
|
||||||
|
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 10)
|
||||||
|
Wyjaśniona wariancja: 0.5410
|
||||||
|
Czas wykonania PCA: 0.01 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie PCA z 12 komponentami...
|
||||||
|
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 12)
|
||||||
|
Wyjaśniona wariancja: 0.6090
|
||||||
|
Czas wykonania PCA: 0.02 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie PCA z 14 komponentami...
|
||||||
|
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 14)
|
||||||
|
Wyjaśniona wariancja: 0.6728
|
||||||
|
Czas wykonania PCA: 0.02 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie PCA z 16 komponentami...
|
||||||
|
Wymiary danych po redukcji PCA: (858, 16)
|
||||||
|
Wyjaśniona wariancja: 0.7342
|
||||||
|
Czas wykonania PCA: 0.03 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Wyniki redukcji wymiarowości zapisane do: wyniki/dim_reduction/23082025-clean/dimension_reduction_results_TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean.json
|
||||||
|
|
||||||
|
Wybrano najlepszą wersję redukcji wymiarowości: pca_8
|
||||||
|
Wymiary domyślnego zbioru treningowego: (600, 8)
|
||||||
|
Wymiary domyślnego zbioru testowego: (258, 8)
|
||||||
|
|
||||||
|
Dostępne wersje zredukowanych danych:
|
||||||
|
pca_8: Train (600, 8), Test (258, 8)
|
||||||
|
pca_10: Train (600, 10), Test (258, 10)
|
||||||
|
pca_12: Train (600, 12), Test (258, 12)
|
||||||
|
pca_14: Train (600, 14), Test (258, 14)
|
||||||
|
pca_16: Train (600, 16), Test (258, 16)
|
||||||
|
|
||||||
|
Czas przygotowania danych: 0.16 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
======= KLASYCZNY SVM (BASELINE) =======
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: default
|
||||||
|
Wymiary danych: X_train (600, 8), X_test (258, 8)
|
||||||
|
Rozpoczęcie GridSearchCV dla default...
|
||||||
|
Najlepsze parametry klasycznego SVM (default): {'C': 100, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||||
|
Dokładność klasycznego SVM (default): 0.9500
|
||||||
|
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - default):
|
||||||
|
precision recall f1-score support
|
||||||
|
|
||||||
|
Astrocytoma, NOS 0.88 0.79 0.83 19
|
||||||
|
Astrocytoma, anaplastic 0.89 0.95 0.92 42
|
||||||
|
Glioblastoma 0.98 0.94 0.96 109
|
||||||
|
Mixed glioma 0.90 0.97 0.94 38
|
||||||
|
Oligodendroglioma, NOS 0.97 0.97 0.97 33
|
||||||
|
Oligodendroglioma, anaplastic 0.94 0.94 0.94 17
|
||||||
|
|
||||||
|
accuracy 0.94 258
|
||||||
|
macro avg 0.93 0.93 0.93 258
|
||||||
|
weighted avg 0.94 0.94 0.94 258
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (default):
|
||||||
|
Accuracy: 0.9419
|
||||||
|
Precision: 0.9431
|
||||||
|
Recall: 0.9419
|
||||||
|
F1 Score: 0.9418
|
||||||
|
ROC AUC: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Macierz pomyłek:
|
||||||
|
[[ 15 2 0 1 1 0]
|
||||||
|
[ 0 40 2 0 0 0]
|
||||||
|
[ 1 3 103 2 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 37 0 1]
|
||||||
|
[ 0 0 0 1 32 0]
|
||||||
|
[ 1 0 0 0 0 16]]
|
||||||
|
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (default): 1.30 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_8
|
||||||
|
Wymiary danych: X_train (600, 8), X_test (258, 8)
|
||||||
|
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_8...
|
||||||
|
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_8): {'C': 100, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||||
|
Dokładność klasycznego SVM (pca_8): 0.9500
|
||||||
|
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_8):
|
||||||
|
precision recall f1-score support
|
||||||
|
|
||||||
|
Astrocytoma, NOS 0.88 0.79 0.83 19
|
||||||
|
Astrocytoma, anaplastic 0.89 0.95 0.92 42
|
||||||
|
Glioblastoma 0.98 0.94 0.96 109
|
||||||
|
Mixed glioma 0.90 0.97 0.94 38
|
||||||
|
Oligodendroglioma, NOS 0.97 0.97 0.97 33
|
||||||
|
Oligodendroglioma, anaplastic 0.94 0.94 0.94 17
|
||||||
|
|
||||||
|
accuracy 0.94 258
|
||||||
|
macro avg 0.93 0.93 0.93 258
|
||||||
|
weighted avg 0.94 0.94 0.94 258
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_8):
|
||||||
|
Accuracy: 0.9419
|
||||||
|
Precision: 0.9431
|
||||||
|
Recall: 0.9419
|
||||||
|
F1 Score: 0.9418
|
||||||
|
ROC AUC: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Macierz pomyłek:
|
||||||
|
[[ 15 2 0 1 1 0]
|
||||||
|
[ 0 40 2 0 0 0]
|
||||||
|
[ 1 3 103 2 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 37 0 1]
|
||||||
|
[ 0 0 0 1 32 0]
|
||||||
|
[ 1 0 0 0 0 16]]
|
||||||
|
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_8): 1.29 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_10
|
||||||
|
Wymiary danych: X_train (600, 10), X_test (258, 10)
|
||||||
|
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_10...
|
||||||
|
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_10): {'C': 10, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||||
|
Dokładność klasycznego SVM (pca_10): 0.9750
|
||||||
|
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_10):
|
||||||
|
precision recall f1-score support
|
||||||
|
|
||||||
|
Astrocytoma, NOS 0.94 0.89 0.92 19
|
||||||
|
Astrocytoma, anaplastic 0.93 0.98 0.95 42
|
||||||
|
Glioblastoma 0.98 0.97 0.98 109
|
||||||
|
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 38
|
||||||
|
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||||
|
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||||
|
|
||||||
|
accuracy 0.98 258
|
||||||
|
macro avg 0.98 0.97 0.97 258
|
||||||
|
weighted avg 0.98 0.98 0.98 258
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_10):
|
||||||
|
Accuracy: 0.9767
|
||||||
|
Precision: 0.9770
|
||||||
|
Recall: 0.9767
|
||||||
|
F1 Score: 0.9767
|
||||||
|
ROC AUC: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Macierz pomyłek:
|
||||||
|
[[ 17 1 1 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 41 1 0 0 0]
|
||||||
|
[ 1 2 106 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 38 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||||
|
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_10): 1.24 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_12
|
||||||
|
Wymiary danych: X_train (600, 12), X_test (258, 12)
|
||||||
|
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_12...
|
||||||
|
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_12): {'C': 10, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||||
|
Dokładność klasycznego SVM (pca_12): 0.9817
|
||||||
|
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_12):
|
||||||
|
precision recall f1-score support
|
||||||
|
|
||||||
|
Astrocytoma, NOS 0.95 0.95 0.95 19
|
||||||
|
Astrocytoma, anaplastic 0.95 1.00 0.98 42
|
||||||
|
Glioblastoma 0.98 0.97 0.98 109
|
||||||
|
Mixed glioma 1.00 0.97 0.99 38
|
||||||
|
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||||
|
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||||
|
|
||||||
|
accuracy 0.98 258
|
||||||
|
macro avg 0.98 0.98 0.98 258
|
||||||
|
weighted avg 0.98 0.98 0.98 258
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_12):
|
||||||
|
Accuracy: 0.9806
|
||||||
|
Precision: 0.9809
|
||||||
|
Recall: 0.9806
|
||||||
|
F1 Score: 0.9806
|
||||||
|
ROC AUC: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Macierz pomyłek:
|
||||||
|
[[ 18 0 1 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||||
|
[ 1 2 106 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 1 37 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||||
|
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_12): 1.27 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_14
|
||||||
|
Wymiary danych: X_train (600, 14), X_test (258, 14)
|
||||||
|
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_14...
|
||||||
|
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_14): {'C': 0.1, 'gamma': 'scale', 'kernel': 'linear'}
|
||||||
|
Dokładność klasycznego SVM (pca_14): 0.9833
|
||||||
|
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_14):
|
||||||
|
precision recall f1-score support
|
||||||
|
|
||||||
|
Astrocytoma, NOS 0.90 0.95 0.92 19
|
||||||
|
Astrocytoma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 42
|
||||||
|
Glioblastoma 0.99 0.99 0.99 109
|
||||||
|
Mixed glioma 1.00 0.97 0.99 38
|
||||||
|
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||||
|
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||||
|
|
||||||
|
accuracy 0.99 258
|
||||||
|
macro avg 0.98 0.99 0.98 258
|
||||||
|
weighted avg 0.99 0.99 0.99 258
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_14):
|
||||||
|
Accuracy: 0.9884
|
||||||
|
Precision: 0.9888
|
||||||
|
Recall: 0.9884
|
||||||
|
F1 Score: 0.9885
|
||||||
|
ROC AUC: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Macierz pomyłek:
|
||||||
|
[[ 18 0 1 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||||
|
[ 1 0 108 0 0 0]
|
||||||
|
[ 1 0 0 37 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||||
|
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_14): 1.38 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Testowanie klasycznego SVM na wersji danych: pca_16
|
||||||
|
Wymiary danych: X_train (600, 16), X_test (258, 16)
|
||||||
|
Rozpoczęcie GridSearchCV dla pca_16...
|
||||||
|
Najlepsze parametry klasycznego SVM (pca_16): {'C': 100, 'gamma': 0.01, 'kernel': 'rbf'}
|
||||||
|
Dokładność klasycznego SVM (pca_16): 0.9917
|
||||||
|
Raport klasyfikacji (klasyczny SVM - pca_16):
|
||||||
|
precision recall f1-score support
|
||||||
|
|
||||||
|
Astrocytoma, NOS 0.86 0.95 0.90 19
|
||||||
|
Astrocytoma, anaplastic 0.95 1.00 0.98 42
|
||||||
|
Glioblastoma 0.99 0.95 0.97 109
|
||||||
|
Mixed glioma 1.00 1.00 1.00 38
|
||||||
|
Oligodendroglioma, NOS 1.00 1.00 1.00 33
|
||||||
|
Oligodendroglioma, anaplastic 1.00 1.00 1.00 17
|
||||||
|
|
||||||
|
accuracy 0.98 258
|
||||||
|
macro avg 0.97 0.98 0.97 258
|
||||||
|
weighted avg 0.98 0.98 0.98 258
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Szczegółowe metryki dla modelu Klasyczny SVM (pca_16):
|
||||||
|
Accuracy: 0.9767
|
||||||
|
Precision: 0.9781
|
||||||
|
Recall: 0.9767
|
||||||
|
F1 Score: 0.9770
|
||||||
|
ROC AUC: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Macierz pomyłek:
|
||||||
|
[[ 18 0 1 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 42 0 0 0 0]
|
||||||
|
[ 3 2 104 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 38 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 0 33 0]
|
||||||
|
[ 0 0 0 0 0 17]]
|
||||||
|
Czas trenowania i ewaluacji klasycznego SVM (pca_16): 1.50 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
Wyniki klasycznego SVM zapisane do: wyniki/dim_reduction/23082025-clean/classic_svm_results_TCGA_GBM_LGG_Mutations_clean.json
|
||||||
|
|
||||||
|
======= SVM Z JĄDREM KWANTOWYM =======
|
||||||
|
Brak wyników w cache, używanie tymczasowych wyników.
|
||||||
|
|
||||||
|
DEBUG - Wymiary danych treningowych: (600, 8)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_l2 z C=0.1...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l2...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=0.1: 0.7417 (czas: 4.14 s)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_l2 z C=1.0...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l2...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=1.0: 0.8517 (czas: 4.10 s)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_l2 z C=10.0...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l2...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l2, C=10.0: 0.8700 (czas: 4.09 s)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_l1 z C=0.1...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l1...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=0.1: 0.4183 (czas: 4.09 s)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_l1 z C=1.0...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l1...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=1.0: 0.4500 (czas: 4.08 s)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_l1 z C=10.0...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją l1...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_l1, C=10.0: 0.8350 (czas: 4.09 s)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_min-max z C=0.1...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją min-max...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=0.1: 0.7900 (czas: 4.17 s)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_min-max z C=1.0...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją min-max...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=1.0: 0.8817 (czas: 4.25 s)
|
||||||
|
Testowanie Amplitude_min-max z C=10.0...
|
||||||
|
Używanie kodowania amplitudowego z normalizacją min-max...
|
||||||
|
Dokładność kwantowego SVM z Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9300 (czas: 4.20 s)
|
||||||
|
Najlepszy kwantowy SVM: Amplitude_min-max z C=10.0, dokładność: 0.9300
|
||||||
|
Ewaluacja najlepszego modelu z kodowaniem amplitudowym (normalizacja: min-max)...
|
||||||
|
Raport klasyfikacji (najlepszy kwantowy SVM z kodowaniem amplitudowym, normalizacja: min-max):
|
||||||
|
precision recall f1-score support
|
||||||
|
|
||||||
|
Astrocytoma, NOS 0.89 0.89 0.89 19
|
||||||
|
Astrocytoma, anaplastic 0.86 0.90 0.88 42
|
||||||
|
Glioblastoma 0.95 0.96 0.96 109
|
||||||
|
Mixed glioma 0.95 0.95 0.95 38
|
||||||
|
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.97 0.98 33
|
||||||
|
Oligodendroglioma, anaplastic 0.93 0.82 0.87 17
|
||||||
|
|
||||||
|
accuracy 0.94 258
|
||||||
|
macro avg 0.93 0.92 0.92 258
|
||||||
|
weighted avg 0.94 0.94 0.94 258
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Szczegółowe metryki dla modelu Kwantowy SVM z kodowaniem amplitudowym (min-max):
|
||||||
|
Accuracy: 0.9380
|
||||||
|
Precision: 0.9387
|
||||||
|
Recall: 0.9380
|
||||||
|
F1 Score: 0.9380
|
||||||
|
ROC AUC: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Macierz pomyłek:
|
||||||
|
[[ 17 2 0 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 38 4 0 0 0]
|
||||||
|
[ 1 3 105 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 1 36 0 1]
|
||||||
|
[ 1 0 0 0 32 0]
|
||||||
|
[ 0 1 0 2 0 14]]
|
||||||
|
|
||||||
|
Całkowity czas dla kwantowego SVM: 40.34 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
======= PODEJŚCIE HYBRYDOWE =======
|
||||||
|
Używanie mniejszego zbioru danych dla ewaluacji: (240, 8)
|
||||||
|
Tworzenie problemu QUBO dla optymalizacji hiperparametrów...
|
||||||
|
Używanie 3 map cech w podejściu hybrydowym: ['Amplitude_l2', 'Amplitude_l1', 'Amplitude_min-max']
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l2, C=0.1: 0.7417
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l2, C=1.0: 0.8517
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l2, C=10.0: 0.8700
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l1, C=0.1: 0.4183
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l1, C=1.0: 0.4500
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_l1, C=10.0: 0.8350
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_min-max, C=0.1: 0.7900
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_min-max, C=1.0: 0.8817
|
||||||
|
Używanie wcześniej obliczonego wyniku dla Amplitude_min-max, C=10.0: 0.9300
|
||||||
|
Czas tworzenia problemu QUBO: 0.00 sekund
|
||||||
|
Rozwiązywanie problemu QUBO za pomocą wyżarzania kwantowego...
|
||||||
|
Czas wyżarzania kwantowego: 0.03 sekund
|
||||||
|
Optymalne hiperparametry z wyżarzania kwantowego: feature_map=Amplitude_min-max, C=10.0
|
||||||
|
Trenowanie modelu hybrydowego z kodowaniem amplitudowym (normalizacja: min-max)...
|
||||||
|
Czas trenowania modelu hybrydowego: 2.07 sekund
|
||||||
|
Czas ewaluacji modelu hybrydowego: 0.90 sekund
|
||||||
|
Dokładność ostatecznego modelu hybrydowego: 0.9380
|
||||||
|
Raport klasyfikacji (model hybrydowy):
|
||||||
|
precision recall f1-score support
|
||||||
|
|
||||||
|
Astrocytoma, NOS 0.89 0.89 0.89 19
|
||||||
|
Astrocytoma, anaplastic 0.86 0.90 0.88 42
|
||||||
|
Glioblastoma 0.95 0.96 0.96 109
|
||||||
|
Mixed glioma 0.95 0.95 0.95 38
|
||||||
|
Oligodendroglioma, NOS 1.00 0.97 0.98 33
|
||||||
|
Oligodendroglioma, anaplastic 0.93 0.82 0.87 17
|
||||||
|
|
||||||
|
accuracy 0.94 258
|
||||||
|
macro avg 0.93 0.92 0.92 258
|
||||||
|
weighted avg 0.94 0.94 0.94 258
|
||||||
|
|
||||||
|
|
||||||
|
Szczegółowe metryki dla modelu Model hybrydowy:
|
||||||
|
Accuracy: 0.9380
|
||||||
|
Precision: 0.9387
|
||||||
|
Recall: 0.9380
|
||||||
|
F1 Score: 0.9380
|
||||||
|
ROC AUC: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Macierz pomyłek:
|
||||||
|
[[ 17 2 0 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 38 4 0 0 0]
|
||||||
|
[ 1 3 105 0 0 0]
|
||||||
|
[ 0 0 1 36 0 1]
|
||||||
|
[ 1 0 0 0 32 0]
|
||||||
|
[ 0 1 0 2 0 14]]
|
||||||
|
|
||||||
|
Całkowity czas dla podejścia hybrydowego: 3.03 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
======= PORÓWNANIE WYNIKÓW =======
|
||||||
|
Klasyczny SVM: 0.9767441860465116
|
||||||
|
Kwantowy SVM (bez wyżarzania): 0.9300
|
||||||
|
Model hybrydowy: 0.9380
|
||||||
|
|
||||||
|
======= PORÓWNANIE CZASÓW WYKONANIA =======
|
||||||
|
Czas przygotowania danych: 0.16 sekund
|
||||||
|
Czas klasycznego SVM: 1.50 sekund
|
||||||
|
Czas kwantowego SVM: 40.34 sekund
|
||||||
|
Czas podejścia hybrydowego: 3.03 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
======= ANALIZA ZNACZENIA CECH =======
|
||||||
|
Wytrenowanie modelu na oryginalnych danych do analizy znaczenia cech...
|
||||||
|
Najważniejsze cechy dla klasyfikacji:
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.2725
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.2221
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.2202
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.2198
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.1264
|
||||||
|
|
||||||
|
Czas analizy znaczenia cech: 3.04 sekund
|
||||||
|
|
||||||
|
======= KLUCZOWE MUTACJE ZWIĄZANE Z KLASYFIKACJĄ NOWOTWORÓW =======
|
||||||
|
Kluczowe mutacje:
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Glioblastoma: 0.2725
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, NOS: 0.2221
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Mixed glioma: 0.2202
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Astrocytoma, anaplastic: 0.2198
|
||||||
|
Primary_Diagnosis_Oligodendroglioma, anaplastic: 0.1264
|
||||||
|
|
||||||
|
======= PODSUMOWANIE EKSPERYMENTU =======
|
||||||
|
Data i czas zakończenia: 2025-08-26 10:54:39
|
||||||
|
Całkowity czas eksperymentu: 54.65 sekund (0.91 minut)
|
||||||
|
|
||||||
|
======= PODSUMOWANIE METRYK =======
|
||||||
|
Klasyczny SVM:
|
||||||
|
accuracy: 0.9767441860465116
|
||||||
|
precision: 0.9780563106144502
|
||||||
|
recall: 0.9767441860465116
|
||||||
|
f1: 0.9770045777038696
|
||||||
|
roc_auc: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Kwantowy SVM:
|
||||||
|
accuracy: 0.937984496124031
|
||||||
|
precision: 0.9387009631195677
|
||||||
|
recall: 0.937984496124031
|
||||||
|
f1: 0.9380005221212427
|
||||||
|
roc_auc: N/A
|
||||||
|
|
||||||
|
Model hybrydowy:
|
||||||
|
accuracy: 0.937984496124031
|
||||||
|
precision: 0.9387009631195677
|
||||||
|
recall: 0.937984496124031
|
||||||
|
f1: 0.9380005221212427
|
||||||
|
roc_auc: N/A
|
||||||
Loading…
Reference in New Issue